Alphafold2-Pytorch（WIP）
要最终成为一个非官方的工作Pytorch实施 ，令人叹为观止的注意网络解决CASP14。 随着体系结构的更多细节发布，将逐步实施。
复制完成后，我打算将所有可用的氨基酸序列在计算机上折叠起来，并作为学术洪流发布，以供进一步科学使用。 如果您对复制工作感兴趣，请在此#alphafold
安装
$ pip install alphafold2-pytorch
用法
像Alphafold-1一样预测分布图，但要注意
import torch
from alphafold2_pytorch import Alphafold2
from alphafold2_pytorch . utils import MDScaling , center_distogram_torch
model = Alphafold2 (
dim = 256 ,
2022-08-30 19:28:37
8.73MB
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AlphaFold2 可以周期性地以原子精度预测蛋白质结构，在技术上利用多序列对齐和深度学习算法设计，并结合关于蛋白质结构的物理和生物学知识提升了预测效果。它实现了 2/3 蛋白质结构预测的卓越成绩并在去年登上了《自然》杂志。
2022-08-01 20:05:45
8.68MB
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