nf-core / dualrnaseq 要运行管道，请安装并拉出以下内容： 下一个流 码头工人 git pull https://github.com/bhagesh-codebeast/nextflowdualrnaseq.git 样本数据存储在data/dualrnaseq/文件夹中。 注意：运行命令nextflow run main.nf -profile demo,docker执行管道。 引文 Philip Ewels，Alexander Peltzer，Sven Fillinger，Harshil Patel，Johannes Alneberg，Andreas Wilm，Maxime Ulysse Garcia，Paolo Di Tommaso和Sven Nahnsen。 Nat Biotechnol。 2020年2月13日。doi： 。 ReadCube：

模数流 Nextflow管道，用于从NCBI SRA下载和处理微生物RNA序列数据 设置 安装 检查的Java 8或更高版本安装使用： java -version 将nextflow下载到当前目录： curl -s https://get.nextflow.io | bash curl -s https://get.nextflow.io | bash 通过运行以下./nextflow run hello测试安装： ./nextflow run hello 安装 为您的数据集准备元数据文件。 使用来获取指定生物的所有元数据。 要附加本地数据，您可以向tsv文件中添加新行，并填写以下各列： Experiment ：对于公共数据，这是您的SRX ID。 对于本地数据，应使用标准化的ID命名数据（例如ecoli_0001） LibraryLayout ：要么成对或非单 Platfo

核能系统

成绩单 微生物RNA序列管线