跨数百个基因组进行基因家族注释的管道 该管道可以自动化并标准化新生成的基因组数据集中许多基因家族的基因家族注释。 该管道可以获取最准确的基因拷贝数，并最大程度地减少可能会干扰下游比较分析的方法论偏见。 BITACORA和GeMoMa是用于识别和注释基因组装配中的基因家族的主要工具，第一步是基于输入文件以及要注释的基因家族信息，使用Blastp和InterProScan识别和管理基因模型。 内容 先决条件 安装 计算要求 用法 4.1准备数据 4.2运行管道 4.3输出 例子 1.先决条件 运行管道所必需的依赖关系是： Perl ：大多数操作系统默认安装Perl。 有关安装说明，请参见 。 Python ：从下载可用的最新版本 BLAST ：从以下地址下载blast可执行文件：ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATE

植物冷胁迫下ICE-CBF-COR通路中的基因调控和信号转导，王大志，靳亚楠，低温是限制植物生长和生产的关键非生物胁迫因素。植物应答低温依赖于分子调控网络通路及其中的耐冷相关基因。ICE-CBF-COR通路是植物�

不同物种酪氨酸酶相关蛋白1（TYRP1）基因的生物信息学分析，郑会芹，李祥龙，酪氨酸酶相关蛋白1（TYRP1）是酪氨酸酶家族的一个成员，不仅参与黑素生成，并且可以抑制黑素细胞的死亡，稳定酪氨酸酶活性和有助于

该书从基因、RNA、蛋白质、表观遗传学四个方面介绍计算生物学和生物信息学知识、案例。作者是Ka-Chun Wong。该电子书文字可复制。

咖啡店 软件基因˚F爱米莉Ë旋涡的Çomputational一nalysis CAFE的目的是通过解释系统进化史并为进化推论提供统计基础的方式来分析基因家族大小的变化。 该程序使用生与死过程来模拟用户指定的系统发育树中的基因得失。 在此模型下生成的家庭规模分布可为评估观察到的分类单元之间家庭规模差异的重要性提供基础。 到 CAFE v4.2.1是CAFE应用程序常规发行版中的最新版本。 该手册和各种教程可以在网站（ ）上查看。 本文档介绍了如何下载和使用CAFE v4.2.1。 用 CAFE v4.2.1的必要输入是： 一个数据文件，包含系统发育树中包含的分类单元的基因家族大小 Newick格式的系统发育树，包括分支长度 根据以上输入，CAFE v4.2.1将计算： 整个树上或树中用户指定的分支子集上的生死参数λ的最大似然值λ（或单独的生死参数（分别为λ和μ）） 系统发育树中

mybatis-generator逆向生成持久层代码，所需jar包，版本1.3.6

funannotate是用于基因组注释的管道（专门为真菌构建，但也可用于高级真核生物）。 有关安装，使用和更多信息，请参见 最快启动Docker： 您可以使用funannotate运行funannotate 。 需要注意的是，GeneMark不包含在Docker映像中（请参阅下面的许可，您可以向开发人员投诉，因为它难以分发/使用）。 我还编写了一个bash脚本，该脚本可以运行docker映像并自动检测/包括正确的用户/卷绑定。 该docker映像是基于master中的最新代码构建的，因此它将早于标记的发行版。 该映像还包括所需的数据库，如果您只想在没有数据库的情况下进行注解，则该映像位于nextgenusfs/funannotate-slim hub以及nextgenusfs/funannotate-slim 。 因此，可以通过以下方式实现此路线： # download/pull th

java material Operator to select genes pool from the current Population.<p></p> * Different selection schemes are supported.<p></p>

mybatis-generator-1.3.6.jar是在guithub网站开源的工具软件由于现在zf的防火墙导致无法下载，csdn一下居然要5积分感觉不是太划算所以这里下载下来供大家使用。

基因表达式编程GEP(Gene Expression Programming)是一种基于生物基因结构和功能发明的一种新型自适应演化算法。GEP 是从遗传算法（geneticalgorithms ,简称GAs）和遗传程序设计（genetic pro2gramming ,简称GP）中发展而来，它在吸收了二者优点的同时,又克服了二者的不足之处，其显著特点就是可以利用简单编码解决复杂问题