matlab中的GM模型代码CTseg:脑部CT分割,标准化,颅骨剥离和总脑/颅内体积计算
概述
这是用于对计算机断层扫描(CT)脑部扫描进行分割和空间归一化的算法。
该模型是流行的统一分割例程(SPM12软件的一部分)的扩展,具有:改进的配准,高斯混合模型参数的先验知识,从MRI和CT(更多类)中学习的地图集。
这些改进导致了更强大的分割程序,该程序可以更好地处理具有大量噪声和/或较大形态变异性的图像(请参见上图)。
该算法可以产生以下的原始|经调制的空间分段:
灰质(GM)
白质(WM)
脑脊液(CSF)
骷髅头(骨)
软组织(ST)
背景(BG)
该实现是在MATLAB中完成的,并且取决于SPM12软件包(及其MB工具箱)。
如果您发现该代码很有用,请考虑引用“参考”部分中的出版物。
更多详细信息
CTseg的输入应作为NIfTI文件(
.nii
)提供。
所得组织分割的格式与SPM12分割例程的输出格式相同(
c*
,
wc*
,
mwc*
)。
归一化的分割(
wc*
,
mwc*
)在MNI空间中。
默认情况下,将生成输入图像的不ss_骨的版本(将ss_前缀为原始文件名)。
2021-09-09 09:41:33
312KB
系统开源
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