学习利用MATLAB提取DNA序列特征建立向量的方法,掌握利用FCM命令进行DNA分类的方法,学会做出分类图形直接给出分类结果的MATLAB编程。
2021-12-23 16:45:48 91KB DNA序列分类 实验报告
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数学建模 摘要:该文采用模糊聚类分析的方法对 DNA序列进行分类。首先从 DNA序列中单个碱基分布的“密度”角度出发,提取出 DNA序列的特征,然后用模糊聚类分析中常用的方法对 DNA序列进行分类。该文运用自行研制开发的集成 11种模糊聚类 分析算法的模糊聚类分析运算工具,首先对已知的1—20个DNA序列进行模糊聚类分析,根据分类结果的精度,找出了较优 的6种聚类分析算法,然后用余下的21—4O个 DNA序列进行分类;最后,本文一次对所有的1—40个 DNA序列进行归类, 并综合了所有的分类结果,将难以归类的 DNA序列进行了归类。分析结果表明,模糊聚类分析算法具有分类简单且分类结 果精度较高的优点。 关键词:模糊聚类分析法;相关系数法;序列;碱基密度 中图分类号:TB115 文献标识码:A
2021-12-16 00:03:38 337KB 模糊 DNA
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本模型充分利用了所给数据的特点,运用统计、最优化等数学方法,从已知样本序列中提炼出能较好代表两类特征的关键字符串,据此提出量化的分类标准,能较好的对任给DNA序列进行分类.首先,从已知样本序列中用广度优先法选出所有重复出现的字符串,并计算其标准化频率及分散度.然后,利用样本数据结合最小二乘法确定两类字符串各自的优先级函数,并且逐步优化其参数使之达到稳定,提高了可信度.最后,根据优先级函数找出关键词,然后确定权数,用层次分析法对未知样本进行分类,并定出显著水平,从而得到了一个比较通用的分类方法.经过检验,此方法对21—40号待测样本进行了很好的分类,对后面的182个DNA序列进行同样的操作,也有较好的效果.
2021-12-01 14:54:56 359KB 建模 DNA序列
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DNA序列分类模型研究的PPT,DNA序列中存在着局部的和全局性的结构,充分发掘序列的结构对理解DNA全序列是十分有意义的。目前在这项研究中最普通的思想是省略序列的某些细节,突出特征,然后将其表示成适当的数学对象。
2021-11-30 21:34:40 814KB 神经网络
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人类基因组计划中DNA全序列草图是由4个字符A,T,C,G按一定顺序排成的长约30亿的序列,其中没有“断句”也没有标点符号。虽然人类对它知之甚少,但也发现了其中的一些规律性和结构。例如,在全序列中有一些是用于编码蛋白质的序列片段,即由这4个字符组成的64种不同的3字符串,其中大多数用于编码构成蛋白质的20种氨基酸。又例如,在不用于编码蛋白质的序列片段中,A和T的含量特别多些,于是以某些碱基特别丰富作为特征去研究DNA序列的结构也取得了一些结果。此外,利用统计的方法还发现序列的某些片段之间具有相关性,等等。这些发现让人们相信,DNA序列中存在着局部的和全局性的结构,充分发掘序列的结构对理解DNA全序列是十分有意义的。目前在这项研究中最普通的思想是省略序列的某些细节,突出特征,然后将其表示成适当的数学对象。
2021-10-07 20:51:52 43KB 数学建模 DNA序列分类
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DNA序列分类 神经网络 监督学习分类 希望你喜欢
2021-09-24 14:01:07 132KB 分类
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数学建模之数学建模实例DNA序列分类 精品论文 非常不错的 Word文档
2021-09-09 20:32:19 243KB 数学建模 论文
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