模糊聚类分析方法在DNA序列分类中的应用

数学建模 摘要：该文采用模糊聚类分析的方法对 DNA序列进行分类。首先从 DNA序列中单个碱基分布的“密度”角度出发，提取出 DNA序列的特征，然后用模糊聚类分析中常用的方法对 DNA序列进行分类。该文运用自行研制开发的集成 11种模糊聚类 分析算法的模糊聚类分析运算工具，首先对已知的1—20个DNA序列进行模糊聚类分析，根据分类结果的精度，找出了较优 的6种聚类分析算法，然后用余下的21—4O个 DNA序列进行分类；最后，本文一次对所有的1—40个 DNA序列进行归类， 并综合了所有的分类结果，将难以归类的 DNA序列进行了归类。分析结果表明，模糊聚类分析算法具有分类简单且分类结 果精度较高的优点。 关键词：模糊聚类分析法；相关系数法；序列；碱基密度 中图分类号：TB115 文献标识码：A