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poppr:package R包,用于对混合(克隆性)生殖种群进行
遗传分析
-源码
Poppr版本2 什么是poppr ? Poppr是一个R软件包,用于分析具有性和克隆繁殖混合模式的人群。 它围绕genind和genlight对象的框架构建,并提供以下实现: 在层次结构的多个级别中的任何一个级别上对人口进行克隆检查 方便的多基因座基因型计数和具有多个层次结构的种群子集 定义多基因座基因型 基因型多样性,均匀性,丰富性和稀疏性指标的计算 引导距离支持遗传距离的树状图的绘制 遗传距离的最小跨度网络图 关联指数的计算( ) 或者 ( ) 已安装R(≥2.15.1)的任何服务器上的批处理 微卫星(SSR)标记的Bruvo距离的计算(以C表示为速度) 从导入数据并导出到 2.0版的新功能: 基因组SNP数据处理 自定义多基因座基因型定义 通过遗传距离折叠多基因座谱系 计算网状最小跨度网络 计算跨snps的滑动窗口中的关联索引 MLG多样性统计的自举 和更多! 有关完整
2022-01-26 08:49:25
2.5MB
r
multilocus-genotypes
genetic-distances
population-genetics
1
遗传模型分析方法 朱军著 介绍了各种
遗传分析
软件的使用方法
本书系统地介绍了近一二十年来在数量遗传学领域的一些新发展,尤 其是混合线性模型的统计分析方法和广义遗传模型的建模原理。所介绍的 统计分析方法包括 ANOVA 法、ML 和 REML 法、MINQUE 法,但是侧重 于 MINQUE 方法的阐述。详细地介绍了方差和协方差估算、遗传效应值预 测的一些新的统计方法。所介绍的遗传模型,不但包括常用的加性−显性模 型和上位性遗传模型,还包括了最近几年创立的动物性连锁模型和种子遗 传模型。在附录中介绍了各种
遗传分析
软件的使用方法。本书所介绍的这 些新遗传模型和分析方法,全然不同于国内外数量遗传学专著所介绍的那 些传统内容。
2021-11-29 10:32:34
2.35MB
遗传模型分析方法,朱军著
1
GenepopV4软件压缩包
一个非常实用的群体遗传学分析软件包 ,适用于对大量的群体遗传学数据进行分析。它主要有以下 3个方面的用途 :1)进行正合检验 ,如对哈迪_温伯格平衡、种群差异和位点间的连锁不平衡进行检验 ;2 )估算经典的群体遗传学参数 ,如Fst和其它相关指数及基因频率等 ;3)可把GENEPOP的输入文件转换为其它常用的群体遗传学分析软件包 (如BIOSYS、FSTAT和LINKDOS)所要求的输入文件格式。
2021-10-16 15:44:28
1.97MB
遗传分析
基因
1
WinQTLCart.exe
以分子标记技术为基础的作物数量性状基因(QTL)的研究成为目前作物遗传育种研究的热点。QTL定位的基本原理是分析标记基因型和数量性状值之间的连锁关系。QTL分析软件winQTLCart2.0使用程序包括:数据准备、软件运行、基因(QTL)定位和分析、制图。QTL定位分析的新方法关联分析利用不同基因座等位变异(基因)间的连锁不平衡关系,进行标记与性状的相关性分析,以达到鉴定特定目标性状基因(或染色体区段)的目的,关联分析大大提高了目标性状基因或者相关QTL的挖掘和定位。
2021-09-09 10:40:01
2.25MB
生物技术
遗传分析
1
NTSYS遗传相似性系数计算及聚类分析方法说明书
分子生物学分析软件NTSYS关于遗传相似性系数及聚类分析的详细步骤说明。小白都能看得懂的方法说明。
2021-09-04 00:04:13
265KB
遗传分析软件
1
GGT2
遗传分析
软件
该软件可用于遗传学分析,遗传距离的计算,连锁不平衡等信息
2021-07-08 10:31:00
2.43MB
遗传分析
1
dnasp5软件
一款群体遗传学分析软件dnasp5,分析单倍型遗传多样性
2021-06-16 09:03:43
4.21MB
群体遗传分析
1
NTSYS-pc(生物形态研究软件).zip
(生物形态研究软件),系统进化树构建,UPGMA 方法 进行聚类分析
2021-05-17 11:00:11
1.72MB
分子标记
遗传分析
1
Arlequin 3.5.1.3 绿色版_人口遗传学分析软件
Arlequin是一款专业的人类遗传学数据分析软件,这款软件主要为从事医学、生物学研究的用户设计,可以从遗传学和人口统计学数据中中挖掘信息,例如:大量的分子序列数据和传统的等基因频率,并提供了很多的方法和统计学检验,能够满足用户多种遗传学分析方便的需求。
2019-12-21 20:38:10
15.16MB
群体遗传分析
1
popgene32 1.32
此为popgene软件安装包 1.32版本 使用说明可网络搜索获得
2019-12-21 18:57:07
1.06MB
统计分析
基因
物种遗传分析
1
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