Poppr版本2
什么是poppr ?
Poppr是一个R软件包,用于分析具有性和克隆繁殖混合模式的人群。 它围绕genind和genlight对象的框架构建,并提供以下实现:
在层次结构的多个级别中的任何一个级别上对人口进行克隆检查
方便的多基因座基因型计数和具有多个层次结构的种群子集
定义多基因座基因型
基因型多样性,均匀性,丰富性和稀疏性指标的计算
引导距离支持遗传距离的树状图的绘制
遗传距离的最小跨度网络图
关联指数的计算( ) 或者 ( )
已安装R(≥2.15.1)的任何服务器上的批处理
微卫星(SSR)标记的Bruvo距离的计算(以C表示为速度)
从导入数据并导出到
2.0版的新功能:
基因组SNP数据处理
自定义多基因座基因型定义
通过遗传距离折叠多基因座谱系
计算网状最小跨度网络
计算跨snps的滑动窗口中的关联索引
MLG多样性统计的自举
和更多!
有关完整
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