系统发育分析纲要.pdf
1.
不同类型序列的多重序列比对 TranslatorX/MAFFT
2.
建树序列的保守区选择（ Gblock
3.
核苷酸饱和度检测（ Xia's test
4.
核苷酸替换模型的选择（ jModeltest/MEGA/ModelFinder
5.
氨基酸替换模型选择（ ProtTest /MEGA/ /ModelFinder
6.
NJ 法重建系统发育树 MEGA
7.
ML 法重建系统发育树（ MEGA/IQ TREE/RAxML
8.
BI 法重建系统发育树（ MrBayes
9.
系统发育树的查看和美化（ Figtree/MEGA
不同类型序列的多重序列比对 TranslatorX/MAFFT
2.
建树序列的保守区选择（ Gblock
3.
核苷酸饱和度检测（ Xia's test
4.
核苷酸替换模型的选择（ jModeltest/MEGA/ModelFinder
5.
氨基酸替换模型选择（ ProtTest /MEGA/ /ModelFinder
6.
NJ 法重建系统发育树 MEGA
7.
ML 法重建系统发育树（ MEGA/IQ TREE/RAxML
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