GSEApy:Python中的基因集富集分析-源码

GSEApy GSEApy：Python中的基因集富集分析。 有关使用GSEApy的示例，请单击此处： 发行说明： : 常见问题解答： GSEApy是GSEA和包装器Enrichr Python实现。 GSEApy可用于RNA序列，ChIP序列，微阵列数据。 它可用于方便的GO富集并以python生成出版物质量数据。 GSEApy有六个可用的子命令： gsea ， prerank ， ssgsea ， replot enrichr ， biomart 。 gsea： gsea模块产生GSEA结果。 输入以gmt格式查询txt文件（FPKM，预期计数，TPM等），cls文件和gene_sets文件。 预排名： prerank模块产生预排名工具结果。 输入期望以.rnk格式提供的具有相关值的预排序基因列表数据集，并以gmt格式提供gene_sets文件。 prer