binner:用于读取 ABI fsa 毛细管文件并进行各种片段分析的 R 包。 在这一点上,AFLPs,但微卫星(SSRs)也在计划中-源码

上传者: 42153691 | 上传时间: 2021-12-11 19:06:53 | 文件大小: 671KB | 文件类型: -
R
宾纳 binner是一个用于处理 DNA 指纹数据的 R 包。 目前,它提供了完整的AFLP分析工作流程: 读取 ABI .fsa文件 归一化电泳图 识别和调整峰值 查看单个电泳图 删除、添加和重命名样本 使用RawGeno算法自动分峰 生成存在-不存在矩阵以在 R 中进行进一步分析(或导出以供其他程序使用,如果您愿意) 安装 您可以使用 Hadley Wickham 的包安装binner 。 install.packages("devtools") install_github("plantarum/binner") 帮助 包裹没有小插图。 我在函数readFSA的帮助文件中提供了一个相当完整的示例。 用 R 用?readFSA打开它(当然在你加载了 biner 之后)。 备择方案 您可能还想考虑两种基于 R 的替代方案: RawGeno当前需要使用第二个程序来读取原始 fsa 数

文件下载

评论信息

免责申明

【只为小站】的资源来自网友分享,仅供学习研究,请务必在下载后24小时内给予删除,不得用于其他任何用途,否则后果自负。基于互联网的特殊性,【只为小站】 无法对用户传输的作品、信息、内容的权属或合法性、合规性、真实性、科学性、完整权、有效性等进行实质审查;无论 【只为小站】 经营者是否已进行审查,用户均应自行承担因其传输的作品、信息、内容而可能或已经产生的侵权或权属纠纷等法律责任。
本站所有资源不代表本站的观点或立场,基于网友分享,根据中国法律《信息网络传播权保护条例》第二十二条之规定,若资源存在侵权或相关问题请联系本站客服人员,zhiweidada#qq.com,请把#换成@,本站将给予最大的支持与配合,做到及时反馈和处理。关于更多版权及免责申明参见 版权及免责申明