MOmicsNTF-源码

上传者: 42153691 | 上传时间: 2021-12-03 20:16:55 | 文件大小: 2.16MB | 文件类型: -
用于在乳腺癌微环境中基于张量的高阶相关分析的Python脚本。 如果使用此代码,请引用以下文章: Shi,M.,Klindziuk,L.和Mollah,S.,2020年。一种非负张量因子分解方法,用于消除乳腺癌中的卷积微环境。 bioRxiv。 1.ificant_test.ipynb RPPA和GCP数据的重要测试。 2. NTF_with_NCP.ipynb 基于NCP实现的非负张量分解。 3. NTF_with_Tensorly.ipynb 基于Tensorly实现的非负张量分解 4. PLSR_NCP.ipynb 基于NCP张量分解结果的PLSR相关分析。 5. PLSR_Tensorly.ipynb 基于NCP张量分解结果的PLSR相关分析。

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