ALRA:基于低秩逼近的scRNA-seq插补方法
自适应阈值低秩近似（ALRA）
介绍
ALRA是一种在单细胞RNA测序数据中插入缺失值的方法，在提供的预印本“使用低秩近似法对scRNA-seq数据进行零保存插值”中进行。 给定一个scRNA-seq表达矩阵，ALRA首先使用随机SVD计算其rank-k近似值。 接下来，每一行（基因）都以该基因最负值的大小为阈值。 最后，矩阵被重新缩放。
该存储库包含用于在R中运行ALRA的代码。ALRA的唯一先决条件是安装随机SVD软件包RSVD，可以将其安装为install.packages('rsvd') 。
这些功能现在为已安装用户提供了一个标志use.mkl ，它可以大大加快基于默认rpca的版本的速度。 请注意，rpca-mkl仍在开发中，并且不在CRAN上，因此它不是必需的软件包，但是如果用户已经安装了rpca-mkl，则可以通过将该标志设置为True来使用它。
用法
请确保将矩阵为行，
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