sortmerna：SortMeRNA：下一代序列过滤和比对工具
Sortmerna
SortMeRNA是用于过滤，定位和聚类的本地序列比对工具。
核心算法基于近似种子，可以对NGS读数进行敏感分析。 SortMeRNA的主要应用是从转录组数据中过滤rRNA。 SortMeRNA将读取（fasta，fastq，fasta.gz，fastq.gz）和一个或多个rRNA数据库文件作为输入文件，并将对齐和拒绝的读取分为两个文件。 其他应用程序包括可通过获得的聚类和分类分配。 SortMeRNA可处理Illumina，Ion Torrent和PacBio数据，并可产生SAM和BLAST样的比对。
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SortMeRNA 4可以在Linux和Windows
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