Genome-Sequencing:使用重叠图,Kmer组成和De-Bruijn图组装Phi-X174基因组-源码

上传者: 42132598 | 上传时间: 2021-12-28 11:48:13 | 文件大小: 12KB | 文件类型: -
使用重叠图,Kmer Composition和De-Bruijn图组装Phi-X174基因组。 披X174 phi X 174(或ΦX174)噬菌体是单链DNA(ssDNA)病毒,是第一个要测序的基于DNA的基因组。 这项工作由弗雷德·桑格(Fred Sanger)和他的团队在1977年完成。在1962年,沃尔特·菲耶斯(Walter Fiers)和罗伯特·辛斯海默(Robert Sinsheimer)已经证明了ΦX174DNA的物理上,共价闭合的圆形度。 诺贝尔奖获得者亚瑟·科恩伯格(Arthur Kornberg)使用ΦX174作为模型,首先证明了在试管中由纯化的酶合成的DNA可以产生天然病毒的所有特征,从而迎来了合成生物学的时代。 Craig Venter研究小组在2003年报告说,ΦX174的基因组是第一个在体外由合成的寡核苷酸完全组装的基因组。 ΦX174病毒颗粒也已在体外成功

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