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上传时间: 2021-03-09 14:06:11
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文件大小: 776KB
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文件类型: ZIP
对偶超图正则化最小二乘(DHRLS)
DHRLS是一种新颖的计算方法,它利用多核学习和Hypergraph正则化最小二乘来预测疾病与基因之间的关联。 1.代码
1)cka_kernels_weights.p:实现CKA算法的函数;
2)construct_Hypergraphs_knn_weight.p:实现超图拉普拉斯矩阵的函数;
3)DHRLS.p:预测疾病与基因之间的关联
4)fold_10.m:实现十折交叉验证的函数
2.数据集
1)疾病名称和基因名称:分别存储疾病名称和基因名称;
2)gene_disease_Y.mat:存储疾病与基因之间的关联矩阵
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3.Predicting_novel_interactions。
此文件夹包含DHRLS模型对960种疾病的Top50预测结果,包括基因名称预测得分和是否已通过验证