GeneticAlgorithm.Protein:为 2D-HP 蛋白质折叠模型开发的遗传算法-源码

上传者: 42131861 | 上传时间: 2021-10-26 22:04:41 | 文件大小: 2.3MB | 文件类型: -
遗传算法(2D-HP 蛋白质折叠) 为 2D-HP 蛋白质折叠模型开发的遗传算法。 该应用程序将创建初始构象(蛋白质折叠),然后应用选择,突变和交叉。 安装 该存储库包含一个 Visual Studio 2013 项目,该项目包括所有依赖项并且可以立即运行。 一般概念 一个构象包含元素 元素是亲水的还是不是 元素相对于构象的位置 元素的方向指向后继位置(左,右,直) 选拔 支持以下选择方法: 健身比例 基于概率的锦标赛 单淘汰赛 “最佳胜利”锦标赛 可以指定锦标赛大小(构象数量)。 记录中 该算法自动记录一个runthrough到average.txt其包含一个人口每一代的平均能量文件。 这可以用于生成如下图(平均垂直能量,水平生成数): 此外,还提供了testTournaments和testRates函数,它们都使用一组参数,对算法进行一次运行。 然后他们稍微更改参数并进行另一次运

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