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上传时间: 2021-12-08 09:29:09
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文件大小: 6.5MB
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文件类型: -
PyCFMID
该软件包是用于的Python软件包,它提供了一种方法,该方法可准确有效地识别电喷雾串联质谱(ESI-MS / MS)生成的光谱中的代谢物。 该程序使用竞争性碎片建模为MS / MS碎片过程和机器学习技术生成概率生成模型,以根据数据调整模型参数。
注意
这不是官方包装器。 由于Linux中的编译错误(问题1),当前仅支持Windows平台。 CFM-ID版本为2.4,可从下载。 CFM-ID 3.x版本仅在Web服务器可用。
安装
pip install git+git://github.com/hcji/PyCFMID@master
用法
fraggraph_gen
该程序可为输入分子生成完整的碎片图或可行片段列表。 它会系统性地破坏分子内的键,并按照上述出版物的2.1.1节中所述检查有效的所得片段。
from PyCFMID.PyCFMID import fragg