qapa:替代多腺苷酸化的RNA序列定量-源码

替代聚腺苷酸化（QAPA）的RNA序列定量 从RNA序列数据（人和小鼠）分析替代聚腺苷酸化（APA）。 QAPA包含两个主要组件： 从基因模型中提取和注释3'UTR序列 基于转录水平丰度计算替代性3'UTR同工型的相对使用量。 请注意，QAPA本身不执行转录本量化。 它依赖于和等其他工具。 安装 QAPA由Python（3.5+）和R脚本组成。 安装以下必备软件： 。 注意：不要使用2.26.0稳定版本，因为groupBy工具存在。 克隆QAPA的最新开发版本并更改目录： git clone https://github.com/morrislab/qapa.git cd qapa 或者，下载最新并解压缩tarball： tar -xzvf qapa-1.2.0.tar.gz cd qapa-1.2.0 安装R软件包optparse，dplyr，data.table和