kmer-cnt:快速简单的k-mer计数器的代码示例，用于指导教学

入门 git clone https://github.com/lh3/kmer-cnt cd kmer-cnt make # C++11 required to compile the two C++ implementations wget https://github.com/lh3/kmer-cnt/releases/download/v0.1/M_abscessus_HiSeq_10M.fa.gz ./yak-count M_abscessus_HiSeq_10M.fa.gz > kc-c4.out 介绍 K-mer计数是许多作图者，组装者和其他工具（例如基因分型仪，宏基因组学分析仪等）的基础。 它是生物信息学中最重要的算法类别之一。 在这里，我们将实现基本的k-mer计数算法，但具有高级工程技巧。 我们将看到更好的工程技术可以走多远。 在此仓库中，每个{kc,yak}-*.