temporal-brain-expression:用于分析BrainSpan发育转录组数据的时空脑表达的脚本

上传者: 42116604 | 上传时间: 2022-05-16 21:09:55 | 文件大小: 20KB | 文件类型: ZIP
R
颞脑表达 基于BrainSpan发育转录组数据分析时空大脑表达的脚本。 BrainSpan数据 单击下载RNA-seq数据(genes_matrix_csv.zip,62.2 MB)。 有关更多信息,请参阅。 文献资料 下载(与上述文件相同)。 在CONFIG.R输入正确的路径。 这是加载BrainSpan数据并控制将输出文件写入何处所需的。 转到src/目录。 运行R CMD BATCH read_rnaseq_data.R以加载和处理BrainSpan数据。 该脚本将生成两个带有BrainSpan数据的.RData文件(运行时间约为15分钟)。 执行分析 运行R CMD BATCH graphics_genes_temporal_trajectories.R以生成基因轨迹图。 运行R CMD BATCH statistics_prenatal-vs-postnatal-te

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