nanofilt:过滤和整理长时间读取的测序数据-源码

纳滤 长时间读取的测序数据的过滤和修整。 根据质量和/或读取长度进行过滤，并在通过过滤器后进行可选的修整。 从stdin读取，写入stdout。 （可选）直接从命令行上指定的未压缩文件中读取。 拟用于： fastq提取后直接 映射之前 在提取和映射之间的流中 另请参阅。 由于计算的读取质量与--summary汇总的质量之间，因此该脚本采用v1.1.0版本，因为它也可选地使用--summary参数。 将此参数与albacore的sequence_summary.txt文件一起使用时，将使用摘要中的质量得分进行过滤。 它也更快。 安装和升级： pip install nanofilt pip install nanofilt --upgrade 或者 conda install -c bioconda nanofilt NanoFilt是为Python 3编写的。 用法： Nan