matlab喷泉码代码-dna-storage:dna-存储

上传者: 38733676 | 上传时间: 2021-09-28 20:19:13 | 文件大小: 2GB | 文件类型: ZIP
matlab喷泉码代码喷泉编码DNA存储系统的协同序列聚类与解码 在这里,存储了用于我的 DNA 存储研究的代码和数据文件。 编码 要编码数据,您可以使用编码器目录中的 LT_code.m。 这是一个 Matlab 文件,我们在本研究中使用了 MATLAB R2019a。 编码策略来自“DNA Fountain 实现了一个强大而高效的存储架构”,Erlich 和 Zielinski,Science 2017。对于 GC-content 和 homopolymer-run 的约束,可以通过固定 Max_run_length、Min_GC_content 和LT_code.m 文件中的 MAX_GC_content。 对于我们的非约束池,我们使用 Max_run_length = 152、Min_GC_content = 0 和 MAX_GC_content = 1。 对于我们的受限池,我们使用 Max_run_length = 3、Min_GC_content = 0.45 和 MAX_GC_content = 0.55。 结果存储在 original_files 目录中。 测序 排序后

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