matlab喷泉码代码-dna-storage:dna-存储
matlab喷泉码代码喷泉编码DNA存储系统的协同序列聚类与解码
在这里，存储了用于我的
DNA
存储研究的代码和数据文件。
编码
要编码数据，您可以使用编码器目录中的
LT_code.m。
这是一个
Matlab
文件，我们在本研究中使用了
MATLAB
R2019a。
编码策略来自“DNA
Fountain
实现了一个强大而高效的存储架构”，Erlich
和
Zielinski，Science
2017。对于
GC-content
和
homopolymer-run
的约束，可以通过固定
Max_run_length、Min_GC_content
和LT_code.m
文件中的
MAX_GC_content。
对于我们的非约束池，我们使用
Max_run_length
=
152、Min_GC_content
=
0
和
MAX_GC_content
=
1。
对于我们的受限池，我们使用
Max_run_length
=
3、Min_GC_content
=
0.45
和
MAX_GC_content
=
0.55。
结果存储在
original_files
目录中。
测序
排序后
文件下载
资源详情
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