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上传时间: 2022-06-01 14:05:21
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文件类型: PDF
为了提高半经典分子动力学模拟中矩阵乘法效率, 通过一种稀疏矩阵分解方法化简矩阵乘法, 基于OpenMP实现矩阵相乘的Winograd并行算法。该算法将Winograd算法中各部分依次采用OpenMP并行计算, 降低了数据通信。在16核服务器上测试表明, 该方法能够显著提高半经典分子动力学模拟中矩阵乘法效率, 并行加速比能够达到9. 47, 并具有良好的可扩展性, 为大分子体系的模拟提供了可能。