matlab代码sqrt-getzlab-LNP:Hess等人的对数正态泊松回归模型。2019年

上传者: 38559646 | 上传时间: 2022-07-10 10:11:08 | 文件大小: 115KB | 文件类型: ZIP
Matlab代码sqrt 对数正态泊松回归模型 运行Hess等人的对数正态泊松回归模型的代码。 2019,“癌症中的乘客热点突变”() 此仓库中有什么? 该存储库包含用于运行贝叶斯对数正态泊松(LNP)回归的MATLAB函数。 我们包括代码,既可以通过MCMC从模型参数的后验分布中进行采样,也可以计算给定一组后验样本(即,计算后验预测p值)的计数的统计显着性。 前述功能适用于对通用计数数据进行建模,而不特定于对体细胞突变计数进行建模。 为此,我们还包括处理Hess等人分析的特定体细胞突变调用的功能。 附带的工具 要对原始计数/协变量数据运行回归,请使用src/regr/pois_LN_reg.m (请参阅demo.m或本自述文件中的) 该工具根据LNP参数(μ,τ,β)的后验分布生成样本。 它不能识别明显的外围计数。 要计算重要性(即LNP后验预测p值),请使用src/regr/regr_post_pred.m 要对手稿中分析的体细胞突变调用运行模型,请使用包装器脚本src/pois_LN_reg_wrapper.m 。 当前,它仅用于处理该手稿特定格式的调用,该调用由生成该手稿的输出

文件下载

资源详情

[{"title":"( 17 个子文件 115KB ) matlab代码sqrt-getzlab-LNP:Hess等人的对数正态泊松回归模型。2019年","children":[{"title":"getzlab-LNP-master","children":[{"title":"README.md <span style='color:#111;'> 3.46KB </span>","children":null,"spread":false},{"title":".gitmodules <span style='color:#111;'> 95B </span>","children":null,"spread":false},{"title":"demo.m <span style='color:#111;'> 888B </span>","children":null,"spread":false},{"title":"funcs","children":null,"spread":false},{"title":"src","children":[{"title":"pois_LN_reg_wrapper.m <span style='color:#111;'> 11.33KB </span>","children":null,"spread":false},{"title":"regr","children":[{"title":"pois_LN_reg.m <span style='color:#111;'> 22.85KB </span>","children":null,"spread":false},{"title":"regr_post_pred.m <span style='color:#111;'> 3.88KB </span>","children":null,"spread":false}],"spread":true},{"title":"gfx","children":[{"title":"qq_jh.m <span style='color:#111;'> 2.41KB </span>","children":null,"spread":false},{"title":"regr_figure.m <span style='color:#111;'> 4.77KB </span>","children":null,"spread":false}],"spread":true},{"title":"util","children":[{"title":"mvtrnd_jh.m <span style='color:#111;'> 669B </span>","children":null,"spread":false},{"title":"hermite.m <span style='color:#111;'> 688B </span>","children":null,"spread":false},{"title":"covar_index.m <span style='color:#111;'> 4.13KB </span>","children":null,"spread":false},{"title":"normgampdf.m <span style='color:#111;'> 640B </span>","children":null,"spread":false},{"title":"regr_NR.m <span style='color:#111;'> 7.25KB </span>","children":null,"spread":false},{"title":"covar_annot.m <span style='color:#111;'> 2.98KB </span>","children":null,"spread":false}],"spread":true}],"spread":true},{"title":"demo.png <span style='color:#111;'> 94.20KB </span>","children":null,"spread":false},{"title":"startup.m <span style='color:#111;'> 118B </span>","children":null,"spread":false},{"title":"ref","children":[{"title":"hermite_roots.txt <span style='color:#111;'> 6.64KB </span>","children":null,"spread":false}],"spread":true}],"spread":true}],"spread":true}]

评论信息

免责申明

【只为小站】的资源来自网友分享,仅供学习研究,请务必在下载后24小时内给予删除,不得用于其他任何用途,否则后果自负。基于互联网的特殊性,【只为小站】 无法对用户传输的作品、信息、内容的权属或合法性、合规性、真实性、科学性、完整权、有效性等进行实质审查;无论 【只为小站】 经营者是否已进行审查,用户均应自行承担因其传输的作品、信息、内容而可能或已经产生的侵权或权属纠纷等法律责任。
本站所有资源不代表本站的观点或立场,基于网友分享,根据中国法律《信息网络传播权保护条例》第二十二条之规定,若资源存在侵权或相关问题请联系本站客服人员,zhiweidada#qq.com,请把#换成@,本站将给予最大的支持与配合,做到及时反馈和处理。关于更多版权及免责申明参见 版权及免责申明