Understanding molecular simulation_

了解分子模拟 - 从算法到应用。 作者：Daan Frenkel 和 Berend Smit 内容 第二版 前言 X11 符号列表 前言 1 引言 Parti Basics 2 统计机制 2.1 熵和温度 2.2 经典统计力学 13 2.2.1 遍历性 15 2.3 问题和练习 3 蒙特卡罗模拟 3.1 蒙特卡罗法 3.1.1 重要性抽样 3.1.2 大都市法 ..27 3.2 基本蒙特卡罗算法 3.2.1 算法 31 3.2.2 技术细节 32 3.2.3 详细平衡与平衡 42 3.3 试验动作 43 3.3.1 平移移动 3.3.2 定向移动 48 3.4 应用 51 3.5 问题和练习 58 内容 4 分子动力学模拟 63 4.1 分子动力学：思想 4.2 分子动力学：一个程序 64 4.2.1 初始化 65 4.2.2 力的计算 4.2.3 运动方程的 积分 69 4.3 运动 方程 4.3.1 其他算法 4.3.2 高阶方案 1477 4.3.3 Liouville 时间可逆算法的公式。77 4.3.4 李雅普诺夫 不稳定性 81 4.3.5 查看verlet算法 的另一种