pdb蛋白质数据库中pdb文件格式介绍，把网站上的帮助文档做成了chm的电子书形式，方便观看。

matlab开发-从一个蛋白质序列到蛋白质序列的查找。这个程序是从一组蛋白质序列中找出一个特定宽度的无网格图案窗口。

SynNetGen 用于创建随机动力学模型、布尔网络和图形的 MATLAB 工具箱。 该工具箱具有高度可扩展性，因此可以轻松添加其他方法以提供从布尔网络生成动态模型的其他方法，以及转换所有三种类型模型的其他方法。 安装 要求 包裹 测试版 需要 2014a 核心功能 2014a 将模型导出到 SBML 2014a 测试 ODE 模型的相等性 2.36.0 绘图 5.11.4 SBML 导入/导出 设置 安装所需软件 克隆仓库 git clone https://github.com/jonrkarr/SynNetGen.git 更改为 /path/to/SynNetGen 打开 MALTAB 运行安装程序 install(); 入门 说明了如何使用这个包： 创建一个随机的无符号无向图 随机化方向和符号以创建随机有符号有向图 将图形转换为随机布尔网络 将布尔网络转换为

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蛋白质组学数据分析

苏州大学有机化学实验-糖、氨基酸、蛋白质的性质.doc

预测蛋白质功能是后基因组时代最具挑战性的问题之一，在大规模数据下采用高性能的功能预测算法能够节省大量的实验时间和成本。利用基于蛋白质相互作用网络的全局优化模型，提出了蛋白质功能预测的蚁群优化算法，算法在考虑全局模型的同时还利用了网络的先验信息，提高了搜索效率，仿真结果表明，蚁群优化算法能够有效对蛋白质功能进行预测，并且对蛋白质相互作用网络中的假阳性、假阴性数据具有较高的容错能力。

蛋白质组学色谱－质谱技术及其数据处理，匡伟，张举华，蛋白质组学已经成为一门重要的生物科学，其作用与地位在后基因组时代尤显突出。本文对蛋白质组学的研究现状和意义进行了综述，并

IQuant是基于等压标记的定量蛋白质组学自动化流水线。 它集成了蛋白质鉴定的后处理工具和高级统计算法，以处理由等压标记标记的肽产生的MS / MS信号，以进行定量。 IQuant可以从图形用户界面（GUI）和命令行界面运行，并且可以与Windows和Linux系统一起使用。 该网站包含IQuant软件，以iTRAQ-8plex标记的用于测试的示例数据和用户手册。 如果您对IQuant有任何疑问，请与我联系：wenbo@genomics.cn。 IQuant的源代码可以在“ https://sourceforge.net/p/iquant/code/”中找到。

将模拟退火（SA） 思想用于求解蛋白质结构预测问题，并在此基础上提出了两个提高解的质量和加快收敛速度的改进策略，计算结果表明改进后的SA 算法的计算效率优于目前常用的遗传算法和Monte Carlo 方法。