SynNetGen:用于生成合成动态转录组和蛋白质组数据的软件-源码

SynNetGen 用于创建随机动力学模型、布尔网络和图形的 MATLAB 工具箱。 该工具箱具有高度可扩展性，因此可以轻松添加其他方法以提供从布尔网络生成动态模型的其他方法，以及转换所有三种类型模型的其他方法。 安装 要求 包裹 测试版 需要 2014a 核心功能 2014a 将模型导出到 SBML 2014a 测试 ODE 模型的相等性 2.36.0 绘图 5.11.4 SBML 导入/导出 设置 安装所需软件 克隆仓库 git clone https://github.com/jonrkarr/SynNetGen.git 更改为 /path/to/SynNetGen 打开 MALTAB 运行安装程序 install(); 入门 说明了如何使用这个包： 创建一个随机的无符号无向图 随机化方向和符号以创建随机有符号有向图 将图形转换为随机布尔网络 将布尔网络转换为