Snakemake中的基本散装RNA-seq管线
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描述
该存储库包含两种基本形式的基本批量RNA-seq管道的演示，即Snakemake （在workflow/目录中）和bash脚本（在bash_workflow/目录中）。
这两个工作流程执行相同的分析，但是Snakemake管道更加健壮和推荐，尽管目前还不够完善。 这个Snakemake管道是作为教程的一部分而创建的，因此避免了使用某些Snakemake的完整/更复杂的实用程序。 尽管如此，它还是对bash工作流程的改进。
Snakemake版本的几个优点。
停止错误，自动删除不完整的文件
发生错误后可以重新运行/重新启动管道，并且仅运行未完全完成的步骤
可以运行到管道中的某个点而无需编辑管道
可以添加新样本并重新运行管道，以便在必要时仅运行处理新样本以及将这些新数据与其他样本数据集成所需的步骤
可以泛化分析
不必预先安装所
2022-02-15 21:37:15
2.87MB
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阿尔弗雷德·工作流程
Python的帮助程序库，用于的工作流作者。
在macOS 10.7+（Python 2.7）上支持Alfred 3和Alfred 4。
Alfred-Workflow通过为您提供工具在几分钟内从API，应用程序或库创建快速且功能强大的Alfred工作流，从而消除了编写工作流的繁琐工作。
始终支持所有当前的Alfred功能。
产品特点
为您的工作流程自动保存的设置API
超简单的数据缓存到期
模糊过滤（智能变音符折叠）
钥匙串支持，用于安全存储密码，API密钥等。
具有的界面的轻量级Web API
后台任务，使您的工作流保持响应
简单生成Alfred JSON反馈
完全支持Alfred的AppleScript / JXA API
捕获并记录工作流错误，以简化开发和支持
“魔术”参数可帮助开发/调试
Unicode支持
预先配置的日志
通过GitHub版本自动检查工作流程更新
通过通知中心发布通知
Alfred 4+功能
高级修饰符
仅Alfred 4的更新（不会中断较早的Alfred安装）
内容
安装
注意：如果您不熟悉Alfred工作流程，请查看
2022-02-07 17:08:15
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