吉布斯采样matlab代码BSFG
丹尼尔·朗西(Sarah
Mukhergee)和丹尼尔·朗西
参考:Runcie,D.和Mukherjee,S.(2013)。
用遗传协方差矩阵的贝叶斯稀疏因子分析剖析高维表型。
遗传学,194(3),753–767。
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甚至没有对适销性或特定用途适用性的暗示保证。
版本历史
V1.0
在以下网站上发布了MATLAB版本:
包括Ayroles_et_al_Competitive_fitness,半同胞设计的模拟
应该能够从纸上复制所有分析(直到Gibbs和模拟中的蒙特卡洛误差)
V1.1
固定计算遗传和相互作用的特效。
论文的计算结果和相应的文本缺少$
A
^
{-1}
$。
这应该不会对本文介绍的分析结果产生太大影响,但需要进行检查。
它不会影响Ayroles分析。
V2.0
几乎完全重写了模型代码,但是应该保持相同的功能(我相信)
变量已被重命名以更接近于论文
2022-05-05 14:51:41
5.18MB
系统开源
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