matlab二次优化代码推断传播树以量化内脏利什曼病的时空传播
该存储库包含
MCMC
代码和模拟代码，用于估计和模拟
[1]
中描述的个体级空间内核内脏利什曼病传播模型的参数。
先决条件
MATLAB
R2017b+
可从
获得，需要用户许可证。
安装和激活说明：
.
运行
MCMC
代码需要以下
MATLAB
工具箱：
优化工具箱
v8.0+
统计与机器学习工具箱
v11.2+
Julia
v1.0.5+，可从
.
安装说明：
。
运行模拟代码需要以下
Julia
包：
CSV
v0.5.20+
数据帧
v0.19.4+
分隔文件
发行版
v0.21.11+
FileIO
v1.2.0+
JLD
v0.9.2+
JLD2
v0.1.11+
线性代数
绘图
v0.20.3+
稀疏数组
统计数据库
v0.32.0+
数据
MCMC
代码和模拟代码需要无法公开提供的数据集（“data_final.mat”和“data_final2.mat”），因为它们包含个人身份信息。
如果您想获得数据的副本，请首先联系。
用于在其上测试
MCMC
算法的模拟数据和代码将在适当的时候添加到此存储库中。
2022-06-27 19:51:07
3.08MB
1