余弦相似度计算matlab代码计算余弦相似度
张伯超
该脚本将从免疫数据库中读取数据并计算不同特征样本之间的余弦相似度。
用法
-d
name
of
database
-s
name
of
subject
-f
field
of
the
columns
used
to
separate
data
-t
size
threshold,
lower
bound
clone
size,
see
methods
below
例如
bash
calCosSim.sh
-d
lp11
-s
D207
-f
tissue
-t
20
将计算来自数据库
lp11
的受试者
D207
的组织样本之间的余弦相似度,仅使用在至少一个组织中具有至少
20
个实例的克隆
**
注意:您将需要访问数据库的权限,在security.cnf
中替换您的用户名和密码。
**
方法
实例
我们认为克隆大小是独特突变序列的数量和在不同测序文库中发现的相同独特序列的所有不同实例的总和。
我们将这种混合克隆大小度量称为“唯一序列实例”。
下限克隆大小
当我们说两个隔间重叠或缺少重叠时,重要的是要确保我们对整个场景有足够的覆盖范
2022-01-06 10:58:24
4KB
系统开源
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