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ugene:UGENE是免费的开源跨平台
生物
信息学软件
乌根 下载UGENE: ://ugeneunipro.github.io/ugene/ 建筑UGENE 先决条件 确保已安装Qt(> = 5.4.2和<= 5.15)开发库: 我们强烈建议您使用Qt在线安装程序将Qt安装到任何操作系统上。 这是Windows和macOS操作系统(也适用于Linux)的主要方式。 要安装Qt,请从Qt官方网站( )下载在线安装程序。 确保已安装以下组件: Qt Prebuild组件 Qt脚本 安装Qt的其他选项: Ubuntu> = 14.04:`sudo apt-get install qt5-default qttools5-dev-tools qtscript5-dev libqt5svg5-dev Ubuntu 12.04: 下载并安装Qt 5.5.1: 设置系统变量:export PATH = $ PATH:〜/ Qt5.5.1 / 5.5 / gcc_64 / bin sudo apt-get install g++ libgl1-mesa-dev libglu1-mesa-dev Fedora: sudo yum ins
2024-01-12 16:27:58
27.73MB
science
workflow
bioinformatics
cross-platform
1
论文研究 - 深入水中:探索
生物
系统中界面水的水电磁和量子电动力学性质
正常的水结构主要通过与双大分子表面相互作用和弱电磁场来维持,这使电子和质子传导性网络得以扩展。 所有标准化学方法都完全依赖于静电,避免了所有提及电动力学和随之而来的辐射场的出现,辐射场支持了水这一概念,即水是通过电磁方式引入生命系统的
生物
效应的主要介质。 量子电动力学(QED)场论产生了液态水作为媒介的愿景,由于其分子电子光谱的独特性,它本身已成为进行远程通讯的重要工具,能够改变其超分子态组织与环境互动的功能。 本文引起人们的关注,即Emilio Del Giudice等人独立显示了界面水(纳米级承压水)。 和Gerald Pollack等人分别包含相干域(CDs)和排除区(EZ),这可以被视为CD,动态水结构的CD的长距离集合,它利用水的特殊性质,例如水电子/质子动力学和对电磁场的有组织响应,以低频接收具有相干性(负性)的电磁编码信号,并对产生的激励进行求和,以促进该相干性在可能影响
生物
系统的频率上重新分布。 讨论了水从液相的普通相干态(散装水)到界面水的半结晶态或玻璃态超相干态的相变及其在
生物
中的作用。 活体的界面水和细胞内水之间的联系,以及1)电子和质子传递之间的热力学相关性,负
2024-01-11 20:21:23
4.27MB
亲水表面与疏水表面
质子转移
1
论文研究 - 植入物材料对后腰椎椎间融合的
生物
力学作用:使用有限元分析并考虑骨密度比较聚醚醚酮和钛间隔物
关于聚醚醚酮(PEEK)间隔物或钛间隔物是否更适合后路腰椎椎间融合(PLIF),几乎没有
生物
力学数据。 这项研究通过使用有限元分析(包括骨骼强度分布)评估了具有不同硬度水平的这些类型的垫片对椎骨的
生物
力学影响。 为了评估PLIF间隔器下陷的风险,我们使用骨质疏松症患者的CT数据建立了腰椎的有限元模型。 然后,我们在L3 / 4中模拟了PLIF,并建立了将人体间隔垫片的硬度设为PEEK和钛的模型。 垫片周围的骨头承受不同的负载条件。 然后,比较了两种模态的断裂单元和一些应力状态。 在两个PLIF模拟模型中,断裂元件和应力都集中在垫片周围的骨头中。 与钛模拟模型相比,模拟PEEK垫片的模型的断裂元件和应力值要小得多。 对于骨质疏松椎骨的PLIF,这表明PEEK垫片处于机械环境中,不易受因骨组织微骨折和与骨重塑相关的融合方面所引起的沉陷的影响。 因此,PEEK垫片在
生物
力学上更有用。
2024-01-11 19:55:57
3.1MB
后路腰椎椎体间融合术
生物力学
有限元分析
聚醚醚酮
1
论文研究 - 骨密度的非线性有限元分析在腰椎后路椎体间融合术中调查椎间笼周围骨的
生物
力学效应
预防椎间融合器在腰椎后路椎间融合器(PLIF)中的下沉需要了解其机制,这尚待完成。 我们旨在通过模拟一名老年妇女的骨质疏松性椎体,通过有限元分析来描述椎间笼下陷的机制。 一名72岁骨质疏松妇女的L2-L5椎骨X线计算机断层扫描扫描数据被用于创建2个FE模型:一个不模拟植入物放置(LS-INT),一个模拟使用聚醚醚酮(PEEK的L3 / 4 PLIF) )笼子(LS-PEEK)。 将负载和模拟活体的力矩应用于这些模型,并进行了以下分析:1)保持架接触面的Drucker-Prager等效应力分布; 2)增量加载过程中L2-L5中损坏元素的分布; 3)保持架接触面的等效塑性应变分布。 在分析1中,在所有负载条件下,LS-PEEK的L3和L4椎骨终板上的Drucker-Prager等效应力都比LS-INT大,并且特别集中在接触表面。 在分析2中,与LS-INT相比,LS-PEEK在沿着笼子接触面的L3椎体中沿着笼子周围的骨骼显示更多的损伤元素,其次是沿着笼子接触面的L4椎体区域。 在分析3中,在LS-PEEK的L3下表面中,等效塑性应变的分布可视为随着载荷的增加,沿着笼子从笼子的后部区域逐渐扩
2024-01-11 19:52:05
1.99MB
生物力学
有限元分析
后路腰椎椎体间融合术
骨质疏松症
1
论文研究 - 在
脂蛋白是从家畜衍生的过敏原之一,对过敏反应的发展具有临床重要性。 它们在不同的动物中都有特征。 具有致敏能力的特征,对于涉及过敏反应的表位知之甚少。 在这里,通过
生物
信息学工具探索了脂蛋白之间交叉反应的潜在抗原区域。 通过系统发育研究,使用了来自不同家畜(小鼠,狗,猫,公牛,仓鼠,马和猪)的几种脂蛋白的氨基酸序列来确定亲缘关系。 通过使用MEGA软件获得具有最高系统发育关系的组。 通过同源性对未在蛋白质数据库中报告的脂蛋白的3D模型进行建模,以识别在这组过敏原的交叉反应性中受损的潜在抗原区域。 变应性脂蛋白的整个数据库和推断的最大似然树的比对将脂蛋白分为五个单系进化枝(此处称为A,B,C,D和E)。 根据多重配对分析,C组(Fel d 4,Rat n 1和Equ c 1)在其氨基酸序列中显示出最高的同一性(58%)。 对保守和暴露残基的分析表明,C组共有三个抗原性区域,可能会促进其交叉反应。 确定了潜在的抗原性位点,用于在本研究中分析的不同脂钙蛋白之间产生交叉反应。 这些研究支持进行定向诱变测试以确认其与脂蛋白的致敏能力的相关性的需要。
2024-01-11 17:37:42
3.33MB
生物信息学
1
论文研究 - 血管炎性和炎症性
生物
标志物与糖尿病性视网膜病变的关系
背景:糖尿病性视网膜病(DR)是糖尿病的常见并发症,也是劳动年龄人口视力下降的主要原因。 对其发病机理了解甚少,但可能涉及低度慢性炎症和血管生成。 这项研究的目的是评估2型糖尿病患者中一种炎症(IL-6)和血管生成细胞因子(VEGF-A)的血清水平与DR的存在和严重程度之间的关系。 方法:从2019年1月至2019年6月,我们对84例患者进行了横断面分析研究,其中31例发展为DR,53例未发展为DR。 所有患者均接受了完整的眼科检查,并通过ELISA技术对IL-6和VEGF-A进行了实验室分析。 我们研究了IL-6和VEGF-A与DR,HBA1c的存在和严重程度以及糖尿病持续时间的关系。 结果:DR组与对照组相比,VEGF-A水平有统计学意义的显着升高(390.5 pg / ml与173.1 pg / ml; p = 0.007)。 两组之间的IL-6水平无显着差异(42.8 pg / ml与31.7 pg / ml; p = 0.10)。 同样,这两种细胞因子与黄斑水肿或DR的严重程度之间没有关联。 IL-6的水平与糖尿病的平衡有关(p = 0.006),而VEGF-A却没有(p =
2024-01-11 17:03:16
274KB
行业研究
1
海芋传粉
生物
学研究
海芋传粉
生物
学研究,曾杏俐,张燕,野外观察海芋的开花过程,了解传粉昆虫在海芋肉穗花序内的访花行为,研究结果表明:海芋肉穗花序下部为雌花,上部为雄花,雌花与雄花之�
2024-01-11 13:35:12
350KB
首发论文
1
河豚白细胞介素-2基因鉴定及其
生物
信息学分析
河豚白细胞介素-2基因鉴定及其
生物
信息学分析,董伟仁,邵健忠, 利用比较基因组学方法,在河豚(Takifugu rubripes)基因组中鉴定了IL-2基因(FrIL-2)。该基因为单拷贝基因,由4个外显子和3个内含子组成
2024-01-11 08:58:23
344KB
首发论文
1
内源蛋白酶和微
生物
对冷藏河豚鱼质构软化的作用研究
内源蛋白酶和微
生物
对冷藏河豚鱼质构软化的作用研究 ,杨静,葛黎红,为探究冷藏过程中河豚鱼质构软化的机制,明确内源蛋白酶和微
生物
对质构软化的作用,对冷藏(4 ℃)河豚鱼的质构及蛋白降解情况进�
2024-01-11 08:51:47
597KB
首发论文
1
进化与瑜伽。 假设:从爬行动物到直觉脑
众所周知,随着时间的流逝,
生物
进化集中在生活人口的逐渐表型和遗传变化上。 自远古时代以来,人类生存的问题就一直困扰着这个人。 有趣的生活和意识概念因学习学科而异。 对于西方
生物
学家来说,生命是一种出生,成长和死亡的能力,而对于瑜伽士来说,生命是一种意识,它与自然界的
生物
相辅相成。 人类的大脑还在进化吗? 保罗·麦克林博士(Paul MacLean)于1960年左右提出的基于经典的著名三位一体大脑的神经科学研究估计,由于从大脑开始经过数百万年的进化,人类大脑中存在该物种的族谱树爬行动物的结构。 这涉及到众所周知的爬虫类大脑(直觉),边缘大脑(情感)和新皮层大脑(理性)三个层次。 像
生物
进化一样,通过不同的自然界也可以考虑精神进化。 神经科学家说,现代人仅发展了三分之一的大脑能力。 根据这一背景,这项研究的主要目的是假设在下一个千年中,具有人类主要素质和人与人之间微妙的基本统一的神经网络的改进的新皮层II或“国际大脑”的发展。 今天的神经学研究表明,相互连接的神经元的网络设计随自私和非自私的思想而变化。 最近,著名的美国精神科医生理查德·戴维森(Richard Davidson)博士也练习
2024-01-10 16:06:29
1.2MB
生物与精神进化
1
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