自适应蚁群算法摘要 :序列 比对是生物信息学的重要研究-rg。蚁群算法是一种新型的模拟进化算法,并被成功地应用于旅行商问题(TSP) 等组合优化问题中。该文将蚁群算法应用于序列比对,并提出基于 自适应调整信息素的改进算法。仿真结果表明这种新的 比对算法是有效的,而它的改进算法的效果更为理想。 关键词:蚁群算法;序列比对 ;信息素在序列比对中的应用
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genedoc(多重序列比对编辑器).rar
2021-04-27 14:02:57 2.5MB 分子生物学 多重序列比较
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动态规划算法的vc++6.0 实现 能实现两蛋白质序列的比对.
2021-04-20 16:10:03 272KB 动态规划 c++ 序列比对
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DNA序列分析软件 DNAssit 3.10 可用于64位windows,DNAssist可不仅仅是对测序结果的。它处理我们平常需要的一些关于DNA,RNA和蛋白质的基本数据,对表达非常有帮助。这里用一个例子来说明它的功能。主要演示①对测序报告(序列比对);②DNA的物化性质、限制性酶切位点图谱分析;③分析蛋白质的物化性质、抗原性、疏水性。
2021-04-15 19:58:01 9.17MB DNA 序列比对
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程序能实现什么 a.完成gap值的自定义输入以及两条需比对序列的输入 b.完成得分矩阵的计算及输出 c.输出序列比对结果 d.使用matplotlib对得分矩阵路径的绘制 一、实现步骤 1.用户输入步骤 a.输入自定义的gap值 b.输入需要比对的碱基序列1(A,T,C,G)换行表示输入完成 b.输入需要比对的碱基序列2(A,T,C,G)换行表示输入完成 输入(示例): 2.代码实现步骤 1.获取到用户输入的gap,s以及t 2.调用构建得分矩阵函数,得到得分矩阵以及方向矩阵 3.将得到的得分矩阵及方向矩阵作为参数传到回溯函数中开始回溯得到路径,路径存储使用的是全局变量,存的仍然是方向而
2021-03-31 23:35:27 475KB python python的 序列比对
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介绍序列比对算法,将序列比对中的问题提出,有兴趣的看看
2020-05-10 20:18:22 134KB 序列比对算法
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序列比对打分矩阵C++(实验报告+源程序) 序列比对打分矩阵C++(实验报告+源程序) 序列比对打分矩阵C++(实验报告+源程序)
2019-12-21 22:22:15 64KB 序列比对打分矩阵 C++
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DNA序列动态规划法比对的C代码,生物信息学的内容,动态规划法
2019-12-21 20:32:38 4KB 序列比对
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具体介绍了如何在NCBI中进行Blast比对,然后利用下载的序列在mega中构建进化树,有许多图片作为范例
2019-12-21 20:10:32 493KB BLAST mega
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