AKtoolbox:Matlab工具箱，用于多序列比对的协同进化分析-开源

开源软件

AK工具箱是一个Matlab工具箱，用于根据简化的BSD许可证分发的蛋白质多序列比对（MSA）的协同进化分析。 AK工具箱的目的是提供一组Matlab函数，这些函数独立于Matlab生物信息工具箱，用于MSA的协同进化分析。目前，此软件包中可用的协同进化方法是统计耦合分析（SCA），子集协方差的显式似然（ELSC），互信息（MI），实测负期望平方方法（OMES），基于麦克兰伦的替代相关性（MCBASC），直接耦合分析（DCA）和logR。该软件包中还包含不同生物信息学矩阵的存档。

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