武汉大学《细胞生物学》期末复习资料汇总

北医--医学细胞生物学资料整理

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诺贝尔奖综述-细胞凋亡.docx

典型相关分析matlab实现代码#SCell用户指南 SCell是一个集成的软件工具，用于从大型单细胞RNA-seq数据集中进行质量过滤，标准化，特征选择，降维迭代，聚类和估计基因表达梯度。 SCell是开源的，并通过直观的图形界面实现。 可从Windows获得Mac，MacOS和Linux的二进制可执行文件，从获得源代码和预处理脚本。 如果您使用此软件进行研究，请引用：Aaron Diaz，Siyuan J. Liu，Carmen Sandoval，Alex Pollen，Tom J. Nowakowski，Daniel A. Lim和Arnold Kriegstein。 。 生物信息学。 2016. doi：10.1093 / bioinformatics / btw201 目录 1.安装 SCell在64位Mac OSX，Windows和Linux下运行。 首先从以下位置下载适当的安装包： 以_web结尾的文件的初始下载量较小，但在安装过程中将下载更多文件。 那些没有_web结尾的东西已经捆绑了所有需要的东西。 下载完成后，双击安装程序，然后按照屏幕上的说明进行操作。 要调用Wi

肿瘤细胞的捕获研究对癌症的诊断和治疗具有重要意义。针对当前人工对捕获后的肿瘤细胞计数耗时长且易受人的主观影响等问题，利用Matlab设计了一种对被捕获的肿瘤细胞进行自动识别与计数的系统。通过对细胞图像进行灰度变换、阈值分割、形态学处理、分水岭分割等处理，提取出细胞区域并计数。通过计算细胞圆形度，将满足圆形度阈值的细胞标记并计数。实验结果表明，被捕获的肿瘤细胞圆形度阈值为0.87，系统自动识别错误率在6.3%左右，具有可行性，能够满足实际需求。

目的 离体筛选小麦耐甘露醇变异细胞系并再生植株。方法 以耐盐系小麦850512r的幼穗和幼胚为外植体诱导胚性愈伤组织。以所得到的胚性愈伤组织为起始材料，采用一步和多步正筛选法离体筛选耐甘露醇变异细胞系。结果 成功获得小麦耐甘露醇变异细胞系，并再生植株。结论 小麦耐甘露醇变异细胞系的离体筛选并再生植株成功，证明在细胞水平上筛选并获得具有潜在耐水分胁迫特性的小麦新品系是完全可能的。

细胞生物学实验和期末考试复习资料

元胞自动机matlab代码UCL iGEM 的 2020 元胞自动机模型 您可以在不同阶段找到 4 个带有 CA 代码的文件夹：背景代码、2D 代码、3D 代码和探索 - 背景代码显示了我们从中汲取灵感来构建此模型的原始 matlab 代码，以及在 Python（Jupyter 笔记本）中运行此代码的一些原始尝试。 如果要运行 CA 的动画（即细胞生长），请使用 figure_gif2.py 代码。 - 在 2D 代码下，您可以在跳转到三维之前访问我们在 2D 网格上达到的最远发展。 如果您想对模型有一个大致的了解，而对计算要求不高，那么这段代码非常棒。 - 在 3D 代码下，您可以找到直接绘制结果的模型的最新版本。 除了模拟的长度和时间步长的数量之外，它还考虑了 h 的大小（网格中每个单元格的大小，以米为单位），这会改变计算扩散所需的时间步长，从而改变模拟的计算成本 - 探索文件夹类似于 3D 代码文件夹，但它被编码，以便将结果保存到本地计算机中的特定文件中，以及在以前的运行中使用并从那里继续的代码。

cell_image_split:这是使用MATLAB分割和计数细胞图像的一种实现