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2021-07-22 17:00:22
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客观的
本教程的目的是通过提供以下步骤来说明用于创建714个无乳链球菌基因组（存储在NCBI数据库中的32个完整基因组和682个草图基因组程序集）的wgMLST和cgMLST模式的chewBBACA管道的完整工作流程。分步说明并显示获得的输出。
在本示例中使用的有关NCBI基因组的所有信息都位于genomes文件夹内的。
请首先执行以下步骤：
安装chewBBACA。 检查“以获取有关如何的说明。 chewBBACA包括一些物种的败家培训文件，包括无乳链球菌。 您可以在查看可用的培训文件列表。 我们已在此存储库中包含无乳链球菌的培训文件。
将此存储库克隆到您选择的本地文件夹。 要克隆，请运行以下命令： git clone https://github.com/B-UMMI/chewBBACA_tutorial
转到克隆的存储库的顶级目录.../chewBBACA_tutorial
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