OCT文件转换器 该存储库包含用于从制造商的专有文件格式中提取原始光学相干断层扫描(OCT)和眼底数据的代码。 动机 制造商使用专有数据格式存储数据通常会阻碍眼科研究。 例如,直到最近,UK Biobank项目中约200,000次OCT扫描仅以Topcon的.fds文件格式提供,这阻止了批量处理和分析。 唯一允许访问这些扫描的免费软件是 ,它是用C ++编写的,不再进行维护。 该存储库旨在提供可用的基于python的工具来读取这些专有格式。 支持的文件格式 .fds(Topcon) .fda(Topcon) .e2e(海德堡) .img(Zeiss) .dcm 安装 需要python 3.7或更高版本。 pip install oct-converter 用法 examples /中包含许多示例用法脚本。 这是读取.fds文件的示例: from oct_converter .
2021-09-27 10:31:57 17KB fda e2e zeiss biobank
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采用逆达曼光栅将二维锁相相干的激光阵列进行相干合束并进行孔径装填是获得远场单一主瓣大功率高光束质量激光输出的一种有效技术方案,将其应用于大尺寸5×5固体激光相干阵列相干合束中,并进行了固体激光阵列合束孔径装填的理论分析和原理性验证实验,测量了系统的实际合束效率,同时进行了后焦面逆达曼光栅的加工和放置误差对合束效率影响的详细分析。实验结果表明,逆达曼光栅用于固体激光阵列相干合束是一种有效的技术方案,且可以通过调节光栅周期和傅里叶透镜焦距来适应系统对激光阵列占空比的要求。这对于开发基于逆达曼光栅相干合束的高功率高光质量的全固态激光系统具有重要的意义。
2021-08-24 22:48:22 3.03MB 激光光学 相干合束 逆达曼光 固体激光
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提出一种随深度变化的色散补偿方法, 用以提升频域光学相干层析成像系统的纵向分辨率。该方法利用迭代算法计算出不同成像深度处的色散补偿系数, 通过数值计算, 得到色散补偿系数与成像深度的关系表达式, 计算出各成像深度处的色散补偿系数, 利用这些色散补偿系数消除相应深度位置处信号的高阶色散相位, 从而有针对性地对系统中参考臂与样品臂的色散失配进行补偿, 消除色散的展宽效应。理论推导和实验结果表明, 光学相干层析成像系统中, 随深度变化的色散补偿方法对各成像深度位置处的信号, 包括成像深度较深位置处的弱信号, 均可以进行有效的色散补偿, 进而得到更多的样品结构信息。
2021-03-11 20:56:55 8.56MB 成像系统 医用光学 光学相干 图像处理
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冠状动脉支架置入已经成为冠状动脉粥样硬化性心脏病的重要治疗手段。药物洗脱冠状动脉支架断裂(CSF)的识别与检测是目前的难点问题。血管内光学相干层析成像(IVOCT)系统以其极高的成像分辨率在CSF识别与检测方面具有独特优势。本文提出了一种在IVOCT中对冠状动脉支架精准重建的方法。该方法利用金属支架具有成像阴影这一特征,在血管边界分割后,将支架及其一定深度阴影的强度值进行累加生成一维数组,然后将一维数组按照回撤次序排列形成支架展开图像。与三维成像、纵切图像等支架重建方法相比,所提方法不仅可以保持支架的整体结构,而且避免了对操作人员空间想象力的要求。本文利用所提重建方法定量识别和分析了CSF,该方法可针对不同的支架结构选择不同的IVOCT成像参数。
2021-03-02 12:05:03 11.5MB 医用光学 相干成像 光学相干 血管内光
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提出一种基于维纳-辛钦定理计算光学相干层析成像(OCT)系统轴向分辨率δz的通用方法:对光源的功率谱密度分布进行傅里叶逆变换,得到其自相干函数,由其半峰全宽值来获得δz。利用该方法计算了高斯和非高斯分布光谱光源OCT系统的δz,通过与厂商给出的产品标称值相比较,验证了本方法对于高斯和非高斯分布光谱光源的正确性。以超宽带白光光源为例,使用滤光片滤除边缘部分光谱后形成非高斯分布光谱,搭建实验系统,实测δz,所得结果与本方法的计算结果较为接近,实验验证了本方法的正确性。本方法对于非高斯分布光谱光源OCT系统δz的计算结果,能为系统设计时的参数考虑与器件选择等提供依据。
2021-03-01 17:06:15 5.26MB 成像系统 光学相干 非高斯分 轴向分辨
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提出了一种利用相干合成线阵高斯光束扫描识别漫反射背景中的猫眼目标的新方法。建立了线阵高斯光束的相干合成数学模型,利用Collins衍射积分公式以及将硬边光阑窗口函数分解为有限个复高斯函数之和的方法,推导了相干合成线阵高斯光束通过猫眼目标和朗伯漫反射体反射后的解析光强分布公式。通过数值计算分析了目标尺寸、光束线阵数对反射光时间分布特性的影响。结果表明,朗伯漫反射体的反射光时间分布不具有周期特征,其尺寸越大,时间分布展宽越大;猫眼目标的反射光时间分布周期特征与目标处的光强纵向分布周期特征相似,其口径越大,丢失的频率特征越多。基于该方法可以有效地从复杂漫反射背景中快速识别出猫眼目标,并估计出漫反射体或猫眼目标的尺寸大小。
2021-02-26 09:06:22 2.85MB 物理光学 相干合成 扫描识别 猫眼目标
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根据Fraunhofer衍射理论,建立了基于相位调制的二维M×N激光相干阵列的远场光强分布理论模型。结合应用实际,对5×5激光相干阵列的远场光强分布进行数值模拟,分析了不同调制相位对远场光强分布的影响。结果表明,远场光强分布的主极大(小)的位置随调制相位变化,相对强度也随之变化;不同阵列结构,光强分布不同,每列(行)相邻两阵元上加载的相位差为π时,出现较多的主极大和次极大且对称分布。这些结果可为应用相位调制去控制远场光强分布提供有益的参考。
2021-02-25 09:08:44 4.87MB 激光技术 相干光学 相干阵列 相位调制
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The feasibility of measuring crater geometries by use of optical coherence tomography (OCT) is examined. Bovine shank bone on a motorized translation stage with a motion velocity of 3 mm/s is ablated with a pulsed CO2 laser in vitro. The laser pulse repetition rate is 60 Hz and the spot size on the tissue surface is 0.5 mm. Crater geometries are evaluated immediately by both OCT and histology methods after laser irradiation. The results reveal that OCT is capable of measuring crater geometries r
2021-02-10 16:05:36 838KB 组织消融 光学相干 CO2激光 170.1020
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We experimentally and theoretically investigated the performance of a fiber-optic based Fourier-domain common-path optical coherence tomography (OCT). The fiber-optic common-path OCT operated at the 840-nm center wavelength. The resolution of the system was 8.8 \mum (in air) and the working depth us
2021-02-10 16:05:36 395KB 光学相干X 傅里叶光 110.4500 070.0070
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Spectral domain polarization-sensitive optical coherence tomography (SDPS-OCT) is a depth-resolved polarization-sensitive interferometry which integrates polarization optics into spectral domain optical coherence tomography (SD-OCT). This configuration can obtain birefringence information of samples
2021-02-10 16:05:35 835KB 光学相干 双折射 偏振 170.4500
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