酿酒高粱蛋白质的分类组成及相关特性研究，陈华蓉，陈双，研究高粱蛋白的分类组成及其特征，对于深入高粱蛋白质组分与微生物发酵相关机理及蛋白质发酵过程中的高效利用具有重要作用。本文

从Hadder看蛋白质分子中的加氢算法.doc

PDB 蛋白质 结构 数据集，是一个专门收录蛋白质及核酸的三维结构资料的数据库，拥有十分悠久的历史，由美国布鲁克黑文国家实验室的 Walter Hamilton 于 1971 年起开始构建收集。 PDB 数据库中信息主要包含：蛋白质/核酸来源，蛋白质/核酸分子组成，原子坐标，测定结构所用实验方法，以及温度因子、结构测定者等其它数据及信息。可以在 PDB 数据库查找核糖体、致癌基因、药物靶标，甚至整个病毒的结构。

1. PDB数据库中查找蛋白质结构数据 1.　http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do 2. 查找蛋白质结构，在检索框输入关键字或名称。 二. 在线观看三维数据结构 4. 选择 3D view，可视化蛋白三维结构视图呈现。由于是远程计算机服务器进行图型构建，且数据 量较大，需要较长的时间才能在窗口显示。 5.蛋白结构显示的参数设定： 脚本选项： 2. 下载三维数据文件 1. 在查询结果窗口的右边找到以下图型。 如图：选择Download Files。 2．确定下载的文件类型，一般根据你要使用蛋白质结构数据而定。 选择PDB File(Text). 3. 用写字板打开PDB文件，可以看到蛋白质数据库文件实质也是文本文件。 4. 下载Pymol，并安装。点DOWNLOAD进入下载，选择windows版本，并安装（需要pay money）。 或到此网站下载：http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/#pymol 选择win32，1.7.1.1版本。并安装，需要python编程软件的支持，可从360软件管件直接 安装。安

联系方式 用于简单蛋白质残基-残基接触图绘制的 Python 包。 。 安装 ContactVis 可以从 PyPi 安装： pip -U ContactVis 或者 easy_install -U ContactVis 用法 在Python内： from contactvis import plot_contact_map plot_contact_map.plot_map(fasta_filename, contact_filename, factor, c2_filename='', psipred_filename='', pdb_filename='', is_heavy=False, chain='', sep=',', outfilename='') 终端： [--psipred_horiz PSIPRED_HORIZ]

蛋白质接触矩阵是3D蛋白质结构中氨基酸残基之间距离的2D表示。 蛋白质接触图生成器（PCMGen）是一种命令行工具，它将蛋白质3D结构（PDB格式的文件）作为输入，并计算两条链（来自单个或两个不同的蛋白质）之间的接触距离。 这些矩阵文件可以使用其他可视化工具/程序（如R-heatmaps）进一步可视化为Contact Maps。 接触图可用于理解蛋白质：1.二级结构2.构象排列3.表面相互作用

蛋白质设计及蛋白质网络模型的研究

Stride 是用于分配蛋白质二级结构的软件。这个包将它包装在一个 Julia 包中

基质辅助激光解析飞行时间质谱分析条件及准确度对蛋白质数据库搜索结果的影响

宏蛋白质组双向电泳与蛋白质数据库