ProteoWizard库和工具是一组模块化且可扩展的开源,跨平台工具和软件库,可促进蛋白质组学数据分析。 这些库通过提供一个健壮的,可插拔的开发框架来实现快速的工具创建,该框架可简化和统一数据文件的访问,并执行标准化学分析和LCMS数据集计算。 核心代码和库受Apache开源许可; 供应商库受各种特定于供应商的许可的约束。 产品特点 HUPO-PSI mzML标准质谱数据格式的参考实现 支持HUPO-PSI mzIdentML 1.1标准质谱分析格式 支持直接从许多供应商原始数据格式中读取(在Windows上) 现代C ++技术和设计原理 具有本机编译器的跨平台(Windows上的MSVC,Linux上的gcc,OSX上的darwin) 模块化设计,可测试性和可扩展性 快速开发数据分析工具的框架 适用于学术和商业项目的开源许可证(Apache v2) 正式建造状态 操作系统 状态
2023-01-30 10:30:15 914.55MB C#
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Folin-酚试剂法测蛋白质含量测定实验报告
2022-12-20 14:21:30 3.9MB 文档资料
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参考文献:MUFOLD-SS: New deep inception-inside-inception networks for protein secondary structure prediction 目的:蛋白质二级结构预测。 上传原因:由于文献中的链接失效,因此将之前下载的开源源码上传。仅限学术研究使用。
2022-12-09 12:27:01 93.44MB 生信 python
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有生物信息学的参考书;有文献数据挖掘的详细讲解;介绍文献编辑软件以及相关课堂练习;核酸,蛋白质序列分析以及数据分析以及相关上机操作的作业流程
2022-11-07 12:34:22 170.35MB 生物信息 核酸 蛋白质 数据挖掘
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DomFun DomFun是使用系统方法将功能分配给未知蛋白质的新系统,而无需考虑其序列但其功能域与功能系统相关联。 它使用在蛋白质结构域和功能注释之间计算的关联作为训练数据集,并通过查找蛋白质的结构域以及它们是否已与功能注释(在GO分子功能,生物学过程,KEGG和Reactome途径术语中)相关联,对蛋白质进行预测(使用UniProt标识符)。 )。 安装 将此行添加到您的应用程序的Gemfile中: gem 'DomFun' 然后执行: $ bundle 或自己安装为: $ gem install DomFun 用法 要使用DomFun,有必要计算蛋白质结构域和功能注释之间的关联。 为此,请使用NetAnalyzerRubygem( ),选择最适合您数据的关联索引。 一旦计算出这些关联,它们将用于训练DomFun并预测一组功能未知的蛋白质(赋予UniProt标识符)。 在
2022-10-28 15:42:40 32KB Ruby
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基因工程与蛋白质工程知识归纳及试题例析样本.doc
2022-10-15 09:07:14 130KB 计算机
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酿酒高粱蛋白质的分类组成及相关特性研究,陈华蓉,陈双,研究高粱蛋白的分类组成及其特征,对于深入高粱蛋白质组分与微生物发酵相关机理及蛋白质发酵过程中的高效利用具有重要作用。本文
2022-08-12 11:11:27 555KB 首发论文
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从Hadder看蛋白质分子中的加氢算法.doc
2022-07-13 18:07:12 457KB 技术资料
PDB 蛋白质 结构 数据集,是一个专门收录蛋白质及核酸的三维结构资料的数据库,拥有十分悠久的历史,由美国布鲁克黑文国家实验室的 Walter Hamilton 于 1971 年起开始构建收集。 PDB 数据库中信息主要包含:蛋白质/核酸来源,蛋白质/核酸分子组成,原子坐标,测定结构所用实验方法,以及温度因子、结构测定者等其它数据及信息。可以在 PDB 数据库查找核糖体、致癌基因、药物靶标,甚至整个病毒的结构。
2022-07-13 16:05:24 27.45MB 数据集
1. PDB数据库中查找蛋白质结构数据 1. http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do 2. 查找蛋白质结构,在检索框输入关键字或名称。 二. 在线观看三维数据结构 4. 选择 3D view,可视化蛋白三维结构视图呈现。由于是远程计算机服务器进行图型构建,且数据 量较大,需要较长的时间才能在窗口显示。 5.蛋白结构显示的参数设定: 脚本选项: 2. 下载三维数据文件 1. 在查询结果窗口的右边找到以下图型。 如图:选择Download Files。 2.确定下载的文件类型,一般根据你要使用蛋白质结构数据而定。 选择PDB File(Text). 3. 用写字板打开PDB文件,可以看到蛋白质数据库文件实质也是文本文件。 4. 下载Pymol,并安装。点DOWNLOAD进入下载,选择windows版本,并安装(需要pay money)。 或到此网站下载:http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/#pymol 选择win32,1.7.1.1版本。并安装,需要python编程软件的支持,可从360软件管件直接 安装。安
2022-07-11 09:04:58 1.39MB 文档资料