OCTproZ：OCTproZ是用于光学相干断层扫描处理和可视化的开源软件

CT重建过程中的各种工具类算法（包括产生稀疏视角图像、各种格式数据变换）

matlab中存档算法代码SIRT-FISTA-TV重建算法 SIRT-FISTA-TV是一种规则化的迭代重建算法，对嘈杂和模糊的数据非常健壮，并且可以大大减少丢失的楔形伪影。 它包括三个步骤： SIRT更新（也可以使用SART和OS-SART） 电视最小化（使用渐变下降） FISTA技术可加快收敛速度 使用CUDA mex函数可在GPU上加速该算法。 它取决于两个工具箱：ASTRA和Spot。 使用了ASTRA的投影和反投影功能。 Spot工具箱用于提供一个MATLAB框架，该框架将线性运算包装到行为类似于矩阵的MATLAB对象中。 我们提供了两个示例来测试该算法：example1.m和example2.m，它们在正确执行安装后应该很容易运行。 安装 在MATLAB文件浏览器中选择“ ASTRA-工具箱”，“ Spot-工具箱”，“电视最小化”和“数据” ----->右键单击----->添加到路径----->选定文件夹和子文件夹。 请注意，如果不是这样，您可以键入命令“ filebrowser”以打开MATLAB文件浏览器。 安装CUDA工具包（8.0版效果很好）链接： 安装C ++

演示计算机断层扫描图像重建基本原理的函数。 特别是反向投影、使用 Ramlak 滤波器和迭代重建的滤波反向投影。 它还包含用于创建 singoram（将图像转换为氡空间）的函数。

纳米计算机断层扫描(nano-CT)对于推动科技发展和生产技术进步具有极其重要的意义,在生物医学前沿研究及新材料特性研究中的作用尤为突出。概述了纳米CT成像的基本原理、分类,以及纳米CT系统的实现方式和优缺点。在具体技术细节上,重点分析实现纳米CT成像的光学元件的原理、性能、加工制造的瓶颈和应用现状。在此基础上,提出纳米CT成像系统和应用方面存在的问题,并对未来纳米CT成像的发展进行了展望。

EIT_Sphere_Reconstruction 是一个工作示例 GUI，用于为深部大脑中的高阻抗电极进行电阻抗断层扫描图像重建。 该代码用于分析（模拟）通过 NeuroNexus 阵列记录的阻抗模式，并包括针对 NOSER 过度正则化伪影的新伪影去除程序。 此代码依赖于 EIDORS V3.8 来完成大部分实际计算，但可能适用于其他版本的 EIDORS。 还包含一些示例数据以帮助您入门

idl代码与Matlab 3D断层扫描到网络 该项目导入水凝胶颗粒的层析切片，使用分水岭分割对其进行分离和标记，并跟踪接触和变形以获取力网络和织物信息。 这段代码是用Matlab编写的。 如有疑问，请通过以下方式与我联系 文件“ raw_input_image.jpg”显示了我们系统的典型光学切片，其中包含来自散射的噪声和线条伪影。 Matlab代码的第一部分将导入这些图像，并使用FFT过滤器分别对其进行过滤，最终结果是二进制化的图像“ filtered_binary_image.jpg”。 可选地，非本地均值滤波器可以很好地平滑图像噪声。 可以在其他Matlab存储库中找到此类过滤器。 该代码为每个重建的粒子输出粒子文件，包括粒子的质心和表面体素。 代码的后半部分使用此信息使用接触力学从接触区域计算粒子接触（重叠）和相应的接触网络（织物张量）和应力张量。 要获取粒子轨迹（时间序列数据），可以使用粒子跟踪代码，例如John Crocker，David Grier和Eric Weeks开发的代码：

fault-floor-R.f3grid

断层是一个难点，怎么做呢，这里是一个断层实例做的方法，初手就跳过，中级人员仔细看好了。

微小的工具集，可以使用平行光束几何结构从二维投影中对三维物体进行断层扫描重建，从而进行简单的实验。 zip 文件包含以下文件： buildSystemMatrix.m：为三维平行光束几何体设置断层扫描系统矩阵 getNoise.m：创建一个高斯白噪声向量。 phantom3d.m：创建经典 Shepp-Logan 测试图像的三维扩展。 该文件由 Matthias Schabel 制作并在 FEX 上发布，文件 ID：#9416。 plotLayers.m：显示三维数组的层数。 tomoboxDemo1.m：运行模拟的演示脚本，包括生成测试图像、选择随机投影方向、计算投影、添加噪声，最后使用迭代线性求解器 LSQR 进行重建。 traceRays.m：辅助。 buildSystemMatrix 的函数。