序列对齐 C语言中的Smith-Waterman和Needleman-Wunsch对齐网址: : 作者:艾萨克·特纳(Isaac Turner) 许可证:公共领域更新时间:2015年8月18日 关于 最佳局部(Smith-Waterman)和全局(Needleman-Wunsch)对齐算法的C实现。 编写为快速,便携式和易于使用。 命令行实用程序smith_waterman和needleman_wunsch提供了极大的灵活性。 代码也可以轻松地包含在第三方程序中,有关示例,请参见nw_example/和sw_example/目录。 还包括perl模块,以向程序提供perl API。 特征: 对齐任意一对ASCII序列(DNA,蛋白质,单词等) 指定比对评分系统或选择通用的评分系统(BLOSUM等) 指定与给定分数的任何字符匹配的通配符 与局部和全局对齐之间不存在不匹配( --
2021-09-27 09:41:46 118KB C
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将人类HEXA基因和老鼠的作比对,发现差异,有利于疾病根源的确定。
2021-09-26 15:59:47 1KB MATLAB 生物信息学
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基于布尔逻辑的双序列比对协处理器的设计与实现.pdf
2021-09-26 09:04:08 336KB 处理器 微型机器 数据处理 参考文献
贸易总协定 一个Python程序,用于分析多个序列比对并比较两组物种之间的氨基酸特性
2021-09-14 09:32:12 30KB Python
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一个很不错的DNA序列分析软件,集序列比对、进化树构建于一身。
2021-08-16 12:17:53 439KB 多序列比对
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本人独家编写,88分毕业设计+论文绝对独一无二
2021-08-08 23:46:28 404KB 序列比对 相似性 c#
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软件介绍: MEGA6.06是分子生物学中应用研究中很基础的一个免费转件,安装后可支持fasta、txt的序列文件格式; 主要功能是对核酸、蛋白质的序列比对、序列分析和进化树作图等分析计算;
2021-07-13 10:01:42 37.38MB 其他资源
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ClustalW2 is a general purpose multiple sequence alignment program for DNA or proteins.
2021-06-30 10:19:38 1.6MB Clustal 序列比对 序列分析
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动态规划算法的vc++6.0 实现 能实现两蛋白质序列的比对. 动态规划算法的vc++6.0 实现 能实现两蛋白质序列的比对.
2021-06-24 10:02:23 272KB 动态规划 c++ 序列比对
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AK工具箱是一个Matlab工具箱,用于根据简化的BSD许可证分发的蛋白质多序列比对(MSA)的协同进化分析。 AK工具箱的目的是提供一组Matlab函数,这些函数独立于Matlab生物信息工具箱,用于MSA的协同进化分析。 目前,此软件包中可用的协同进化方法是统计耦合分析(SCA),子集协方差的显式似然(ELSC),互信息(MI),实测负期望平方方法(OMES),基于麦克兰伦的替代相关性(MCBASC) ,直接耦合分析(DCA)和logR。 该软件包中还包含不同生物信息学矩阵的存档。
2021-04-29 17:05:09 264KB 开源软件
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