ChemTraYzer通过分子动力学模拟创建React模型。 它可以作为开放软件（MIT许可）使用。 请在@ https://www.ltt.rwth-aachen.de/cms/LTT/Forschung/Forschung-am-LTT/Model-Based-Fuel-Design/Aktuelle-Projekte/~kqbf/ChemTraYzer/lidx中找到完整的说明/ 1M.Döntgen，M.-D.Przybylski-Freund，LCKröger，WAKopp，AEIsmail，K.Leonhard，“使用React分子动力学模拟自动发现React途径，速率常数和过渡态”，《化学学报》。 理论计算。 11（2015），2517-2524LCKröger，WAKopp，M.Döntgen，K.Leonhard，“评估React性分子动力学模拟中稀有事件的统计不确定性”，化学杂志。 理论计算。 13（2017），3955-3960M.Döntgen，F.Schmalz，WAKopp，LCKröger，K.Leonhard，“通过混合React分子动力学和量子化学模拟
2021-09-11 20:23:14
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BEADS 联合解决了同时基线/趋势/漂移校正和（高斯、泊松）一维信号降噪的问题。 它专为分析化学中出现的正信号和稀疏信号而设计：色谱、拉曼光谱、红外、XRD、质谱等）。 基线对应于缓慢变化的趋势、仪器漂移或背景偏移。 所提出的 BEADS 基线滤波算法基于将一系列（色谱图）峰建模为主要为正、稀疏且导数稀疏，并将基线建模为低通信号。 为了封装这些非参数模型而制定的凸优化问题。 为了说明色谱峰的正性，使用了类似于正则化 l1 范数的不对称惩罚函数。 开发了一种鲁棒的、计算效率高的迭代算法，保证收敛到唯一的最优解。 它实现了发表在论文“Chromatogram baselineestimation and denoising using sparsity (BEADS)”中的方法，作者是 Xiaoran Ning、Ivan W. Selesnick、Laurent Duval， Chemome
2021-08-16 20:08:30
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