alignTools alignTools是用于逐对DNA序列比对的C实现工具的集合。 它包括以下对齐功能: 整体一致性 局部语言 适合对齐(跳跃状态) 重叠对齐 编辑距离 不久的将来将添加更多功能。 版本 0.7.23-r15 开始使用 安装 $ git clone git@github.com:r3fang/alignTools.git $ cd alignTools $ make $ ./bin/alignTools Program: alignTools (pairwise DNA sequence alignment) Version: 0.7.23-r15 Contact: Rongxin Fang Usage: alignTools [options] Command: global global
2023-01-14 16:00:11 145KB C
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C# WebService返回数据四种方法(DataSet, 序列化的DataSet, Microsoft组件处理序列化DataSet, Microsoft组件处理序列化压缩DataSet)及动态调用WebService
2023-01-11 21:20:32 115KB C# 序列化
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序列化与反序列化 序列化:把对象转换为字节序列的过程。 反序列化:把字节序列恢复为对象的过程。 举个例子,在JVM中,对象是以一定形式存在于内存中,然后被JVM识别从而可以以“对象”的方式是用它。那么序列化是什么呢,简单来说就是把内存中的对象的状态先以一种方式导出保存下来以便今后在某地方能够继续使用它。 序列化的组件 IDL(Interface description language)文件:参与通讯的各方需要对通讯的内容需要做相关的约定(Specifications)。为了建立一个与语言和平台无关的约定,这个约定需要采用与具体开发语言、平台无关的语言来进行描述。这种语言被称为接口描述语言(I
2023-01-11 15:45:31 57KB protobuf 序列化 方法
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排序 sequencing是一个Python软件包,用于使用模拟现实的量子控制序列。 sequencing是为研究人员和量子工程师而构建的,它为构建由多种模式组成的量子系统模型以及生成复杂的与时间有关的控制哈密顿量用于提供了直观的框架。 文献资料 对于文件sequencing ,请访问: 安装 pip install sequencing 有关更多详细信息,请参见。 s 主要作者和维护者: 。 贡献 是否想为sequencing做贡献? 查看我们的。 致谢 如果您将sequencing用于发表在期刊文章,预印本,博客文章等上的工作,请使用其DOI引用/确认sequencing项目: 上载范例 为了使其他人可以从您的工作中学习并重现您的工作成果,请考虑将以书面证明的Jupyter笔记本或Python文件的形式为您的出版物执行的模拟演示上传到存储库中。
2023-01-10 23:14:59 6.61MB python quantum quantum-mechanics quantum-computing
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这个脚本做什么? 这是用于在FASTA文件中查找端粒重复序列(TTAGGG / CCCTAA)的工具。 该脚本不做什么? 它只会在序列的开头和结尾寻找端粒。 它仅查找TTAGGG / CCCTAA重复序列的变体。 它是如何做到的? 它以FASTA文件作为输入,并逐一遍历其中的序列。 在每个序列的开头和结尾,它都会忽略N(未知碱基)。 对于每个序列,它将查看前(最后)50个核苷酸,并评估端粒重复覆盖了该序列的多少。 这是故意灵活的,以允许测序错误和端粒基序的序列/长度变化。 更具体地说,如果前50个核苷酸中至少有50%被端粒重复序列覆盖,则将其称为端粒。 在大多数情况下,默认设置50%(-c /-cutoff)和50 nts(-w /-window)似乎效果很好。 一些端粒可能很短,或者与典型的TTAGGG / CCCTAA基序不同。 使用这些参数,它们很可能会被恢复。 但是,可以
2023-01-10 22:44:53 34KB telomeres Python
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ARMA(p,q)的最小二乘估计 非线性最小二乘估计
2023-01-10 15:36:12 682KB ARIMA 时间序列
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对齐方式 已实现的DNA序列比对算法的集合,包括最佳全局比对,带状全局比对和用于多个序列比对的近似算法。
2023-01-10 10:53:40 151KB C++
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关于生物信息学的资料 上面是进化算法在基因序列中的应用
2023-01-10 10:50:55 170KB 生物信息学
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距离估计器 使用双端读取估计两个核苷酸序列片段之间的距离
2023-01-10 08:35:10 17KB TeX
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ANSI转义序列 用ANSI转义序列控制您的终端。该库使用ANSI转义序列制作颜色,光标移动等。·请求功能。 目录 关于该项目 使用控制您的终端。该库使用ANSI ESCAPE SEQUENCE进行颜色和光标移动等。 该库使用模板操纵器,意味着易于使用 支持最大值 建于 该库具有ANSI转义序列,无需外部库。 入门 该库支持ANSI转义序列中的大多数功能,您可以轻松地使用它,并且该库使用操纵器来简化工作。 安装 这是仅标头的库,意味着您可以仅获取一个文件并将其包含在内。 用法 使用此库非常容易,这里是示例Hello world代码, # include < iostream> # include " ../src/srilakshmikanthanp/ANSI.hpp " using namespace srilakshmikanthanp ; int main () { st
2023-01-07 02:34:54 243KB C++
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