isodata的matlab代码博客FishCuT1.2
分割斑马鱼
3D
图像的半自动
MATLAB
程序
获取斑马鱼的显微
CT
图像:1.1。
MicroCT
扫描使用
vivaCT40(Scanco
Medical,瑞士)进行。
使用以下设置获取中等分辨率扫描(21
µm
体素分辨率):55kVp、145μA、1024
个样本、500proj/180°、200
ms
积分时间。
1.2.
使用以下设置获取高分辨率扫描(10.5
µm
体素分辨率):55kVp、145μA、2048
个样本、1000proj/180°、200
ms
积分时间。
使用
Scanco
软件生成单个鱼的
DICOM
文件。
1.3.
一般来说,每次采集中至少同时扫描两条鱼。
从
GitHub
链接下载最新版本的
FishCuT:。
2.1.
从程序的主页下载
FIJI。
2.2.
将包含
FishCuT
的文件夹的路径添加到环境路径中。
2.3.
将
Matlab
与
MIJI
链接。
2.3.1.
安装最新的
Java
SE
Development
Kit,它应该通过系统的
Matlab
Java
路
2022-12-29 16:59:32
440KB
系统开源
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