目录说明:
data:数据集
自行将images文件夹添加到data目录下
source:源码
Coelho2009_ISBI_NuclearSegmentation:
,该源码可以运行通与最新jug兼容.
但主要还是通过以下方法对源码进行跟踪.
环境准备:
在机器上安装好python,pip包管理工具
在该根目录下直接安装所需的软件依赖包:
$sudo apt-get install libfreeimage-dev #解决FreeImage报错,
$sudo apt-get install libmagick++-dev
主要是应为缺少freeimage开发库.
使用如下命令安装相关python依赖包:
pip install -r requirements.txt (#numpy cast bug已解决)
代码运行:
进入到sources目录后,
运行以下语句
python jug
2022-04-21 21:38:24
24KB
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% 用于神经元计数的 Matlab GUI % 频率过滤以去除背景荧光% Otsu 的阈值方法，与用户交互% 原图由郭兰提供
2022-04-18 22:38:52
26KB
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交互式 GUI 允许自动跟踪荧光标记的细胞。 以 8 位 TIFF 文件格式导入荧光标记细胞的延时电影。 设置 4 个强制性参数以在几秒钟内生成细胞轨迹。 导出细胞的迁移统计数据以进行假设检验并生成数字。 提供示例 TIFF 电影和分步教程。
2022-04-18 20:04:44
23.79MB
1
从细胞骨架网络的荧光图像计算形态特征的代码。 有关更多信息，请参阅 Flores 等人。 科学报告9，文章编号3241（2019）
2022-04-18 17:55:20
12KB
1
角点检测代码matlab
细胞计数器
Cell
Counter程序在用Alexa
488对胸腺嘧啶二聚体进行免疫细胞化学染色后，检测细胞数量并量化HeLa细胞中每个细胞的平均荧光强度。用于分析的图像通过CCD相机的落射荧光成像收集。
该程序选择背景上方的明亮区域（损坏的细胞核）。
然后，程序将量化每个单元格中的荧光强度，排除任何亮区（由于非特异性荧光团聚），将所有单元格的总荧光强度取平均值，并对存在的单元格计数。
但是，它可以适用于量化图像中明亮的大致球形区域的平均强度。
它是用Matlab编写的，至少与Matlab
2010及更高版本兼容。
参考
此代码用于分析的数据。
如何使用脚本
输入
该脚本包含几个可调参数。
图像的名称由名称字符串设置。
name
=
'
example.png
'
;
通过调整变量x和y选择包含损坏的单元格的图像区域，该变量与Matlab输出图1（图1A）中所示的边界框左上角的坐标相对应。
边界框的长度由xsize和ysize参数设置。
%
box
x
=
70
;
y
=
25
;
xsize
=
290
;
ysize
=
295
;
同样在图1中是一个
2022-04-18 15:50:40
307KB
1
音视频-图像处理-视网膜细胞分布特征及自适应光学系统对弱视人眼视网膜的研究.pdf
2022-04-18 09:07:16
3.98MB