FitHiC和FitHiC2
Fit-Hi-C(或FitHiC)最初由Ferhat Ay,Timothy Bailey和William Noble于2014年1月19日开发。目前由Ferhat Ay(ferhatay @ lji)进行维护和更新。 .org)和Arya Kaul(akaul @ lji (.org)在拉荷亚变态React和免疫学研究所的中。
当前版本被命名为FitHiC2 (或FitHiC 2.0 ),因为与 FitHiC 相比增加了许多新功能,例如:
发现染色体间的显着相互作用,
应用合并过滤器算法过滤掉假定的旁观者相互作用,并仅保留直接CIS染色体相互作用,
报告相互作用的 bin 对之间的预期接触计数,以及原始(观察到的)接触计数,以评估从预期接触计数中观察到的丰富度。
请使用来讨论/错误报告/分析问题。 发送电子邮件至 fithic@googlegrou
2022-05-16 19:24:52
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Python
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