银莱汤粉剂对食积复合FM1流感病毒感染小鼠血清免疫球蛋白及细胞因子含量的影响，李晓菲，王云辉，目的：探讨银莱汤粉剂对食积复合流感病毒小鼠免疫功能的影响，为银莱汤药效机理的研究提供实验依据。方法：雄性昆明小鼠90只，随�

流式细胞数据分析是一种重要的生物学研究方法，通过检测单个细胞的多种特性，如大小、形状、内部化学成分等，来了解细胞群体的复杂性。在这个领域，CFCS（可能是“流式细胞数据处理系统”）是一款由个人开发的免费软件，专为处理和分析流式细胞数据而设计。下面我们将深入探讨CFCS的功能、使用场景以及它在流式细胞数据分析中的作用。 CFCS的主要功能： 1. **数据导入与预处理**：CFCS能够读取流式细胞仪产生的原始数据文件，通常为FCS格式。这种格式包含了每个细胞的多个测量参数。软件会自动进行预处理，包括校准、背景扣除和补偿，以消除仪器误差和非特异性信号。 2. **作图设门**：CFCS提供了直观的图形界面，用户可以创建多维度的散点图来可视化细胞群体。设门是流式分析的关键步骤，通过设定二维或三维图形上的边界，可以将感兴趣的细胞亚群筛选出来。 3. **统计分析**：CFCS能够执行基本的统计分析，如计数、频率计算、平均值和标准差等。这些统计结果有助于理解细胞亚群的分布和相对比例。 4. **事件分类**：软件可能支持基于特定参数或组合参数的事件分类，这有助于研究人员快速识别出具有特定特征的细胞群体。 5. **数据导出**：完成分析后，CFCS允许用户将结果以常见的表格格式（如CSV或Excel）导出，以便进一步的数据挖掘和报告编写。 6. **可扩展性**：尽管CFCS可能是一个轻量级工具，但它可能提供一定的自定义功能，比如用户可能能够编写自己的脚本或插件，以适应特定的分析需求。 流式细胞数据分析的应用广泛，涵盖免疫学、肿瘤学、发育生物学等多个领域。例如，在免疫学中，CFCS可以帮助研究者识别不同类型的免疫细胞，并分析它们在疾病状态下的变化；在肿瘤研究中，它可以用于检测癌细胞表面标记物，评估治疗效果。 CFCS作为一款免费软件，对于实验室和个人研究者来说，是一个经济实惠的选择，尤其对于那些预算有限但需要进行流式数据处理的项目。然而，需要注意的是，与商业软件相比，CFCS可能在功能和性能上存在限制，且可能没有专门的技术支持团队。因此，用户在使用时需要根据自己的具体需求和技能水平来权衡选择。 CFCS是一款为流式细胞数据分析提供基础支持的工具，它简化了数据处理流程，使非专业用户也能对复杂的细胞数据进行有效的分析和解读。虽然其功能可能相对基础，但对于许多科研项目而言，已经足够满足日常分析需求。

纤维蛋白凝胶承载内皮祖细胞移植梗死心肌后细胞自噬变化，张丹，王海杰，目的 观察心肌梗死后移植内皮祖细胞（endothelial progenitor cells，EPCs）时的细胞自噬变化，研究自噬维持移植细胞存活和纤维蛋白凝胶保�

包含FCS3.0、3.1、3.2版本的英文协议文档，谷歌翻译的中文文档。 包含CRC算法C#版本。 文档均为pdf格式。 如需代码实现文档解析，或需要实现图表显示文档数据，可联系作者，有偿提供。

FCSalyzer 是一个用于分析流式细胞术数据的免费程序。 它是用 Java 编程的，因此应该可以在许多不同的操作系统上运行。 FCSalyzer 提供简单的所见即所得界面，并提供标准分析工具 - 点图、直方图、复杂的门控策略和相关统计。 印象/法律声明 Sven Mostböck Murlingengasse 25/5 1120 Wien Austria 电子邮件：sven_mostboeck@users.sourceforge.net 第二个联系方式：使用 FCSalyzer sourceforge 页面上的公开讨论：http://sourceforge.net/p/fcsalyzer/讨论/

西西李斯特菌-莫尔塞罗 Kristoffer Kiil 的单核细胞增生李斯特菌的分子血清分型脚本 要求：路径中的python3和bwa 用法： Molsero.py -p primes.fsa contigfile.fsa 输出：输出检测到的条带及其各自的大小，并打印预测的血清型。 如果模式与血清型不匹配，则会打印 Eureka。

内容概要：本文详细介绍了如何使用COMSOL 6.1/6.2版本进行球形单细胞电穿孔的动态仿真。首先，文章解释了细胞电穿孔的基本概念及其在科学研究中的重要性，特别是孔密度和电导率这两个关键参数的意义。接着，文章逐步讲解了COMSOL仿真的具体操作步骤，包括模型建立、材料属性设定、物理场选择与设置等。此外，还特别强调了边界常微分方程的处理以及Bode分析的应用，展示了如何通过这些数学工具来优化电穿孔实验参数。最后，文章总结了该仿真工作的意义，即不仅帮助深入理解细胞电穿孔的物理机制，也为实际的生物医学实验提供了理论支持。 适合人群：从事细胞生物学、生物物理学及相关领域的研究人员和技术人员，尤其是对细胞电穿孔感兴趣的科学家。 使用场景及目标：适用于希望通过COMSOL软件进行细胞电穿孔仿真的科研工作者，旨在提高他们对该技术的理解并为其实际实验提供指导。 其他说明：文中提供的具体操作步骤和代码片段可以帮助读者快速上手，同时附带的一些高级技巧也有助于解决可能出现的问题。

本文介绍了如何使用scMetabolism包进行小鼠单细胞代谢激活分数分析。文章详细说明了从基因名转换到代谢分析的全过程，包括如何将小鼠基因名转换为人类基因名，以及如何适配Seurat v4/v5版本。此外，还提供了代码示例和参考链接，帮助读者更好地理解和应用这一分析方法。 在单细胞基因组学和转录组学的研究中，代谢分析是理解细胞生理状态及其在疾病中角色的重要环节。本文所介绍的scMetabolism包，是一个专门用于小鼠单细胞代谢数据处理和分析的工具。它允许研究人员从基因表达数据出发，进行单细胞层面的代谢激活分数分析。在这一过程中，scMetabolism包提供了从基因名转换的功能，这一功能至关重要，因为它涉及将小鼠基因名准确无误地转换为人类基因名，这对于使用人类代谢通路数据库进行分析时是必不可少的步骤。 Seurat是一个广泛使用的R包，用于单细胞RNA测序数据分析，而scMetabolism包特别适配了Seurat的v4和v5版本。这意味着研究人员可以使用Seurat的先进功能，同时结合scMetabolism包提供的代谢分析工具，以实现对单细胞数据的全面解读。文章中不仅详细描述了使用scMetabolism包进行单细胞代谢激活分数分析的步骤，还提供了相应的代码示例。这些代码示例对于初学者来说非常宝贵，因为它们不仅展示了如何操作scMetabolism包，也为如何使用R语言进行单细胞数据分析提供了参考。 通过阅读这篇文章，读者能够了解到在进行单细胞代谢研究时，如何利用scMetabolism包处理数据，并且能够掌握将数据导入Seurat进行进一步分析的方法。文章提供的参考链接也很有价值，它们可以引导读者访问到更多的相关资源和背景信息，从而加深对单细胞代谢分析的理解。 scMetabolism包的出现，为小鼠单细胞代谢研究带来了便利。它不仅提供了一套完整的分析流程，还通过代码示例和详细解释，使得研究人员能够更加有效地进行数据分析。这种分析方法对于理解细胞代谢活动在正常生理和病理条件下的变化至关重要，对于发现疾病相关的新标记物和治疗靶点具有重要意义。 随着单细胞技术的快速发展，利用scMetabolism包进行小鼠单细胞代谢激活分数分析，是推动单细胞代谢研究向前发展的有力工具。通过这种分析，研究人员可以更深入地探索不同细胞类型和状态下的代谢特征，为精准医疗和疾病模型的建立提供坚实的实验和理论基础。 scMetabolism包的发布和应用，展示了生物信息学领域中开源软件开发的活力。该软件包的开发，不仅体现了科研工作者对单细胞代谢研究的重视，也反映了当前生物信息学工具开发的专业性和实用性。未来，随着这一领域的不断拓展，类似的工具包将为生物学研究带来更多的可能性。

细菌生物膜是嵌入在细胞外聚合物（EPS）自身产生的基质中的细菌聚集体，可引起持续的细菌感染，对医学造成重大挑战。 它们对抗生素和宿主防御系统具有顽固性，这使治疗困难且成本高昂。 发现青霉青霉突变体EU2D-21在水下发酵下会产生细胞外酶复合物（淀粉酶，纤维素酶，蛋白酶）。 在30°C下孵育8天后，发现α-淀粉酶，纤维素酶和蛋白酶的最大比酶活性分别为3.04 IU / mg，2.61 IU / mg和3.39 IU / mg。 我们评估了酶复合物靶向和降解不同细菌生物膜的能力。 我们发现它在50°C孵育1小时内降解了大肠杆菌（85.5％），肠炎沙门氏菌（79.72％），铜绿假单胞菌（88.76％）和金黄色葡萄球菌（87.42％）的生物膜。 扫描电子显微镜（SEM），生物膜去除测定和结晶紫测定的定量证明了该酶复合物从细胞表面分离了生物膜外多糖基质和细菌。 这些结果说明了使用这种酶复合物作为抗生物膜治疗剂来根除生物膜的可行性和益处。 这也可以用作改善多药耐药细菌感染治疗的有前途的策略。

巨噬细胞是一类高度异质的细胞群体，在免疫系统中扮演着至关重要的角色。它们不仅能吞噬和消化病原体和异物，还能在体内进行抗原呈递，调节炎症反应，以及参与组织的修复与再生。本文通过在兔子模型上的实验研究，深入探讨了巨噬细胞及其分泌的相关炎症因子在家兔动脉粥样硬化斑块稳定性中所起的作用。 实验中，通过高脂饮食喂养家兔两周，并进行分组，其中模型组接受了腹主动脉内皮的球囊损伤，而假手术组仅暴露动脉但未进行损伤。术后10周采用药物触发的方式激活血管，观察并分析了斑块破裂情况和斑块中巨噬细胞的浸润情况。使用免疫组织化学染色方法来确定斑块中巨噬细胞百分比，并通过Elisa法检测了相关炎症因子CRP、MCP-1和TNF-α的水平。研究结果显示，与假手术组相比，模型组的斑块破裂数量增多，斑块面积较大，泡沫细胞和炎细胞数量多，脂核较大，纤维帽较薄，巨噬细胞浸润百分比和血清炎症相关因子水平均显著升高。这些发现表明，巨噬细胞介导的炎症反应在不稳定斑块模型的形成中发挥着重要作用。 CRP（C反应蛋白）、MCP-1（单核细胞趋化蛋白-1）和TNF-α（肿瘤坏死因子α）是参与炎症反应的主要因子。CRP是一种急性期蛋白，通常在身体遭受感染或组织损伤时水平升高；MCP-1是重要的趋化因子，能够吸引单核细胞迁移到炎症部位；TNF-α是一种多功能的细胞因子，在细胞凋亡、细胞增殖和炎症反应中具有重要作用。这三种因子在动脉粥样硬化的病理进程中起着关键作用，它们的水平升高通常与斑块的不稳定性相关。 球囊损伤内皮细胞导致的血管内皮功能受损，可能促进了动脉粥样硬化的进程。损伤诱导内皮细胞产生炎症因子，这些因子可诱导单核细胞向受损内皮迁移，并分化为巨噬细胞。巨噬细胞吞噬氧化型低密度脂蛋白（ox-LDL）形成泡沫细胞，并产生大量的炎症因子，促进了粥样斑块的形成和发展。此外，巨噬细胞还可能通过分泌基质金属蛋白酶（MMPs）等蛋白酶，削弱斑块的纤维帽，增加斑块破裂的风险。 基于此研究，我们认为，巨噬细胞及它们分泌的炎症因子CRP、MCP-1和TNF-α在促进易损斑块形成和斑块破裂中起着核心作用。因此，通过调节巨噬细胞的功能，降低炎症因子的水平，可能为预防和治疗动脉粥样硬化和斑块破裂提供新的靶点。对于未来的研究方向，可以着重探讨具体分子机制和开发针对这些靶点的干预措施，以期对动脉粥样硬化性心血管疾病提供更有效的预防和治疗策略。