通过串联质谱技术进行多肽测序是蛋白质组学领域中蛋白质识别最强有力的工具之一。因为完整的基因组序列正在迅速地积聚，串联质谱光谱解释的最近趋势早已是数据库搜索。然而，从头测序串联质谱光谱解释仍然是一个公开的问题，它典型地包含质谱专家手工解释。我们为从头测序解释开发了一种新算法SHERENGA，它可以自动地从任何类型质谱仪产生的一个测试光谱集合中学习碎片离子的类型和强度阈值。测试数据用来构建串联质谱光谱表示图中的最佳路径打分。一个高得分路径的分级列表对应了潜在的多肽序列。SHERENGA在解释未知蛋白质的多肽序列和验证全自动、高通量多肽测序数据库搜索算法的结果时是最有用的。