群落构建分析是微生物生态学分析重要的组成部分,成为目前文章发表的热点技术。之前我们介绍了计算beta-NTI(beta nearest taxon index)来进行群落构建分析,但利用beta-NTI推测群落构建有一个前提条件,即系统发育树必须要有遗传信号(phylogenetic signal),但某些功能基因(例如nifH)的遗传发育树往往缺乏遗传信号,此时我们可以计算beta多样性的零偏差来进行群落构建分析。本文包括如下三方面内容,1、如何理解beta多样性零偏差?2、如何计算beta多样性零偏差?3.多核运行可以省多少时间?
2021-12-30 19:03:47 380KB 微生物生态学分析 群落构建