fastq-scan:以 JSON 格式输出 FASTQ 汇总统计信息-源码

上传者: 42179184 | 上传时间: 2021-05-29 16:02:37 | 文件大小: 30KB | 文件类型: ZIP
C++
fastq-scan从 STDIN 读取 FASTQ 并以 JSON 格式输出汇总统计信息(读取长度、每次读取质量、每个碱基质量)。 快速扫描 我想要一种以 JSON 格式输出输入 FASTQ 的简单汇总统计信息的快速方法。 有(可能更好)的替代方案,包括和 ,但它们没有输出我想要的 JSON。 在谷歌搜索后,我偶然发现了映泰的问题: . 在这个问题中,我使用了来自 Pierre Lindenbaum 的 C++ 解决方案的代码作为这个程序的基础。 安装 Bioconda fastq-scan在上。 conda install -c bioconda fastq-scan 从源头 git clone git@github.com:rpetit3/fastq-scan.git cd fastq-scan make 这将使用 g++ 编译程序,我会让你处理把它放在哪里。 我已经在 g

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